Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 1,499,498 | 0 | T | G | 69.8% | 113.9 / 169.7 | 172 | intergenic (+75/‑89) | trpS/zapE | Tryptophan‑‑tRNA ligase/putative enzyme with nucleoside triphosphate hydrolase domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (62/58); minor base C (11/41); total (73/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.01e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGT‑T‑T‑CGGGCACG‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGC > AE015451/1499383‑1499612 | ttCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAcg > 1:1391279/1‑125 (MQ=25) ttCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAc < 2:1390991/124‑1 (MQ=25) tCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCAAAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAcg‑c < 2:1390993/125‑1 (MQ=25) cAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAcg‑c‑c < 2:1390995/125‑1 (MQ=25) gagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAcg‑c > 2:1391299/1‑122 (MQ=25) gagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAc < 2:1390996/120‑1 (MQ=25) gagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCACGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAcg‑c‑ccg > 1:1391128/1‑123 (MQ=21) ccTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAcg‑c‑ccgctc < 1:1390998/125‑6 (MQ=21) cTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTcc > 1:1391221/1‑125 (MQ=18) tGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTccc > 1:1391208/1‑125 (MQ=18) gAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTccc > 1:1391147/1‑124 (MQ=18) gAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCca < 2:1390999/125‑1 (MQ=18) gAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTccc < 1:1391001/120‑1 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAg > 1:1391072/1‑123 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGAc < 2:1391002/125‑1 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGAACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAg > 1:1391268/1‑123 (MQ=18) gCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAg > 2:1391308/1‑121 (MQ=18) cTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTg > 1:1391520/1‑123 (MQ=18) cTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGAt > 1:1391160/1‑125 (MQ=18) ggCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGTACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGa < 2:1391004/121‑1 (MQ=17) caccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCa < 1:1391005/125‑1 (MQ=18) accacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 1:1391007/125‑1 (MQ=18) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAtt > 2:1391240/1‑125 (MQ=18) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAtt > 1:1391185/1‑125 (MQ=18) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAtt < 1:1391010/125‑1 (MQ=18) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 2:1391009/124‑1 (MQ=18) cagcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAg > 1:1391326/1‑125 (MQ=18) agGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCgg < 2:1391012/124‑1 (MQ=18) ggACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCggg < 1:1391014/124‑1 (MQ=18) ggACTGAGGCTGCCAAACGGCGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTAC‑G‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCCTTAAGCGGGc > 2:1391178/1‑125 (MQ=17) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGcc < 2:1391017/125‑1 (MQ=18) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGcc < 2:1391016/125‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1391020/125‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCt < 1:1391018/124‑1 (MQ=18) tGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1391021/124‑1 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc > 1:1391292/1‑125 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc > 2:1391166/1‑124 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 1:1391351/1‑125 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 1:1391218/1‑125 (MQ=18) ggCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg < 1:1391024/124‑1 (MQ=18) 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gggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc < 2:1391037/124‑1 (MQ=18) ggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCg > 1:1391237/1‑119 (MQ=18) cGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttg > 2:1391287/1‑124 (MQ=21) gTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgtt < 2:1391040/125‑1 (MQ=21) tGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgtt > 2:1391213/1‑124 (MQ=21) gCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGc < 1:1391044/125‑1 (MQ=21) 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aaaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa < 1:1391057/125‑1 (MQ=25) aaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTaa > 1:1391304/1‑125 (MQ=25) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTaa > 1:1391468/1‑124 (MQ=25) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAAc > 1:1391250/1‑125 (MQ=25) cAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACg < 1:1391059/125‑1 (MQ=25) ggCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGaa > 1:1391436/1‑125 (MQ=25) 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gcgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGa < 1:1391067/125‑1 (MQ=25) cgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc < 2:1391069/125‑1 (MQ=25) ggTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc > 1:1391294/1‑124 (MQ=25) ggTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACt < 2:1391072/125‑1 (MQ=37) ggTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑GCG‑CGGGCACG‑CGCGCTCCCAGAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGttttt < 2:1391071/99‑1 (MQ=21) gTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgtt < 2:1391075/102‑1 (MQ=21) gTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTc < 1:1391073/125‑1 (MQ=37) aTGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATg < 2:1391077/117‑1 (MQ=25) aTGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCt < 2:1391079/124‑1 (MQ=37) tggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCCTGACTCCCTTa > 2:1391224/7‑125 (MQ=25) caccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTT‑TTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAAc < 2:1391081/122‑1 (MQ=37) ggCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCt < 1:1391083/125‑1 (MQ=38) cTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACATACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTAt < 2:1391085/125‑1 (MQ=38) tttGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCt > 2:1391270/1‑122 (MQ=38) tttGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTAt > 2:1391329/1‑124 (MQ=38) ttGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCa < 1:1391086/125‑1 (MQ=39) tggCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTAt < 2:1391096/121‑1 (MQ=38) gCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACg < 2:1391088/117‑1 (MQ=38) | TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGT‑T‑T‑CGGGCACG‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGC > AE015451/1499383‑1499612 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |