Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	281136	281277	142	2 [0]	[1] 2	yagA	integrase core domain‑containing protein YagA

CGGGAGTGCCCCACCCGGATACCCAGGCGCATCAGCCACAGCTCCAGCGCCGTCCAGGTGCCGGTGGTGTCGCCCCACGGTGAGCCGTTATCCATGGTCATCCGGTCCGGCAGGCCGTAACGCTCAAACACGCTGACCAGCTGCTGCTGCACGGTCTCGCGCCGTTCAT  >  NC_000913/281274‑281442     |                                                                                                                                                                     cGGGAGTGCCCCACCCGGATACCCAGGCGCATCAGCCACAGCTCCAGCGCCGTCCAGGTGCCGGTGGTGTCGCCCCACGGTGCGCCGTTACCCATGGTCATCCGGTCCGGTAGGCCGTAACGCTCAAACCAGCTAACCAGCTGCTGCTGCACGGTCTCGCGCCGt      >  2:265776/1‑165 (MQ=255)     aGTGCCCCACCCGGATACCCAGGCGCATCAGCCACAGCTCCAGCGCCGTCCAGGTGCCGGTGGTGTCGCCCCACGGTGAGCCGTTATCCATGGTCATCCGGTCCGGCAGGCCGTAACGCTCAAACACGCTGACCAGCTGCTGCTGCACGGTCTCGCGCCGTTCAt  <  1:265777/165‑1 (MQ=255)     |                                                                                                                                                                     CGGGAGTGCCCCACCCGGATACCCAGGCGCATCAGCCACAGCTCCAGCGCCGTCCAGGTGCCGGTGGTGTCGCCCCACGGTGAGCCGTTATCCATGGTCATCCGGTCCGGCAGGCCGTAACGCTCAAACACGCTGACCAGCTGCTGCTGCACGGTCTCGCGCCGTTCAT  >  NC_000913/281274‑281442

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑