| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AC_000091 | = 1209382 | 21 (0.160) | 59 (0.540) | 49/146 | 2.3 | 77.5% | coding (305/630 nt) | ycfK | hypothetical protein |
| ? | AC_000091 | = 1211179 | 17 (0.160) | intergenic (‑483/‑83) | tfaE/pin | predicted tail fiber assembly protein/site‑specific DNA recombinase | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCGCACTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AC_000091/1209280‑1209382‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttggtttgggagaaggCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGCCGCTTTTTCTG < AC_000091/1211179‑1211091 CCGCACTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTG < 2:2802398/90‑1 GCACTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTTGAAAACCTTGGT > 2:3360627/1‑90 CACTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTT > 1:2935112/1‑90 CTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTG > 1:274241/1‑90 CTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTG < 2:2442348/90‑1 CTTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTG > 2:2916990/1‑90 TTCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGG > 2:2168092/1‑90 TCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGG > 2:2635269/1‑90 TCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGG > 2:1785529/1‑90 TCGCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGG < 2:2883434/90‑1 GCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAG < 2:89074/90‑1 GCGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAG < 2:2840643/90‑1 CGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGA < 2:211525/90‑1 CGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGA > 1:236093/1‑90 CGCGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGA < 2:209737/90‑1 CGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAG < 1:2232550/90‑1 CGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAG > 2:3383087/1‑90 CGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAG > 2:1275206/1‑90 CGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAG < 2:2871209/90‑1 CGCTGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAG < 1:1478743/90‑1 TGCTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCT < 2:2123827/90‑1 CTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCT < 1:3002337/90‑1 CTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCT > 1:276716/1‑90 CTGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCT < 2:706304/90‑1 TGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTG < 1:2972436/90‑1 TGTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTG < 2:236940/90‑1 GTTAAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGC > 2:1331885/1‑90 AAGCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATT < 2:3469936/90‑1 GCCGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTAC > 2:1033322/1‑90 CGCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCT > 1:3322111/1‑90 GCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTG > 2:2940593/1‑90 GCAAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTG < 1:1805987/90‑1 AAGAATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTT > 2:779762/1‑90 ATCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTG > 1:1930205/1‑90 TCCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGT > 2:685861/1‑90 CCGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTC > 2:1616282/1‑90 CGTTTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCC > 1:1018961/1‑90 TTGGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGG < 1:1820494/90‑1 GGCGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTT < 1:1411179/90‑1 GGCGATATCAAATCGGAGGGCTCTGTGCAAACGGCTCTCGAAATCCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTT < 2:3305832/90‑1 CGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCC < 1:3197517/90‑1 CGATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCC > 1:513855/1‑90 ATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGT > 1:261777/1‑90 ATATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGT < 1:1352955/90‑1 ATCAAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGG > 2:1822291/1‑90 AAATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCT > 1:2552895/1‑90 AATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTT > 1:1366056/1‑90 AATCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTT < 2:832587/90‑1 TCGGATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCA < 2:2334314/90‑1 GATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCC > 2:157476/1‑90 ATGGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCA < 1:3179683/90‑1 GGCACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACT < 1:3350975/90‑1 CACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCC < 1:2333792/90‑1 ACTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCG > 1:2622320/1‑90 CTGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGC > 1:2702938/1‑90 TGTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCC > 1:103917/1‑90 GTGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCA < 2:334699/90‑1 TGCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAA > 2:659339/1‑90 GCAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAAC < 2:78856/90‑1 CAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACA < 2:243327/90‑1 CAAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACA > 2:1181265/1‑90 AAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAG > 2:2954825/1‑90 AAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAG < 1:275271/90‑1 AAACGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAG > 1:549406/1‑90 CGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCT < 1:2408003/90‑1 CGGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCT < 1:2172578/90‑1 GGCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCGGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTG < 1:254514/90‑1 GCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGG < 1:954628/90‑1 GCTCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTCCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGG < 2:568251/90‑1 TCTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCT < 1:3402182/90‑1 CTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCNNNGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTG > 2:3205279/1‑90 CTCGAAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTG > 1:2583418/1‑90 AAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAAT > 1:1356432/1‑90 AAAACCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAAT > 1:3350228/1‑90 CCTTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAA > 2:3066702/1‑90 TTGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATG > 1:908384/1‑90 TGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGG < 2:1644392/90‑1 TGGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGG < 1:564543/90‑1 GGTTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGT > 2:1912694/1‑90 TTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGC > 2:1621499/1‑90 TTTGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGC > 1:261307/1‑90 TGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGCCG > 2:843549/1‑90 TGGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGCCG > 2:1160461/1‑90 GGGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGTCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGAAATGGTGCCGC > 1:2894506/1‑90 GGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGCCGCT < 1:1094291/90‑1 GGAGAAGGCTCTGCATTACCTGTTGGTGTCCCGGTTCCGTGGCCTTCAGCCACTCCGCCAACAGGCTGGCTGAAATGCAATGGTGCCGCT < 1:1544230/90‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |