| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AC_000091 | 175,694 | 0 | T | G | 24.6% | 296.7 / 11.0 | 114 | G196G (GGT→GGG) | clcA | chloride channel, voltage‑gated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/70); new base G (28/0); total (44/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGAC > AC_000091/175606‑175783 | gCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTa < 2:1059435/90‑1 (MQ=255)gCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTa < 2:2012049/90‑1 (MQ=255) cTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTAtt < 1:2634800/90‑1 (MQ=255) cTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGAtt > 1:614638/1‑90 (MQ=255) tGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGAttt > 1:343769/1‑90 (MQ=255) tGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGAttt > 1:1163549/1‑90 (MQ=255) tGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGAttt > 2:2967909/1‑90 (MQ=255) aaaGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTg < 2:408302/90‑1 (MQ=255) aaaGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTg > 1:3410708/1‑90 (MQ=255) aaaGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTg > 1:444315/1‑90 (MQ=255) aaaGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTg > 2:2780195/1‑90 (MQ=255) aaGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGt > 2:119361/1‑90 (MQ=255) aGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGtt < 1:2250155/90‑1 (MQ=255) tGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTttat < 2:1173630/90‑1 (MQ=255) tGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTttat > 1:950756/1‑90 (MQ=255) gACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGtttttt > 1:1617762/1‑90 (MQ=255) gACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTttatt > 2:1546777/1‑90 (MQ=255) gCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGaa > 1:1492359/1‑90 (MQ=255) cTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAag < 1:2853478/90‑1 (MQ=255) tCGGCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAaga < 2:726549/90‑1 (MQ=255) tCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAaga < 2:3448738/90‑1 (MQ=255) tCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTTTTATCGAaga > 1:2143226/1‑90 (MQ=255) cGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAagag < 1:1087899/90‑1 (MQ=255) cGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTCTTTATTATCGAagag < 2:1564196/90‑1 (MQ=255) gCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAgaga < 1:2629188/90‑1 (MQ=255) gCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAgaga < 2:714507/90‑1 (MQ=255) cATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATTGGAGAGATg > 1:3232002/1‑90 (MQ=255) aTACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTTTTTTTTTTTTAAgagaaga > 2:1599812/1‑87 (MQ=255) cGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTc < 1:3009875/90‑1 (MQ=255) gctgctGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTTTTTATTAACTGAGAAATGCGTcc > 1:289506/1‑90 (MQ=255) ctgctgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCg < 1:1345993/90‑1 (MQ=255) ctgctgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGAGTTTTTTTATTTTCCGAGAGGTGGGtgcc > 1:2180695/1‑87 (MQ=255) gctgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCa > 1:2873351/1‑90 (MQ=255) ctgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGGCCGCAg > 2:1402869/1‑90 (MQ=255) tgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTTTTTATTATTGAAGAGATGCGTCCGCAGt > 2:768856/1‑90 (MQ=255) ggCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGtt < 2:16930/90‑1 (MQ=255) ggCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGtt > 2:1207443/1‑90 (MQ=255) gCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGttt < 2:2647856/90‑1 (MQ=255) cAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAAGGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATAGAAGAGATGCGTCCGCAGgttt > 2:3072464/1‑89 (MQ=255) aaCCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCg > 2:582962/1‑90 (MQ=255) aCCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGc > 1:939011/1‑90 (MQ=255) ccGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCt > 2:1199849/1‑90 (MQ=255) ggTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCtat < 2:272431/90‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCtat < 2:1352729/90‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCtat < 1:670222/90‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCtat > 1:1387202/1‑90 (MQ=255) gtcctgctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCtata < 2:602778/87‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCtata < 1:2426523/90‑1 (MQ=255) tgctgctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc < 2:949665/90‑1 (MQ=255) gctgctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACg < 2:887809/90‑1 (MQ=255) tgctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGtt < 1:3243630/90‑1 (MQ=255) gctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTa > 1:782282/1‑90 (MQ=255) gctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTa > 2:1676451/1‑90 (MQ=255) gctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTa > 1:1175576/1‑90 (MQ=255) ctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTaa < 2:1586836/90‑1 (MQ=255) ctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTaa < 2:1410995/90‑1 (MQ=255) ctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTAGCCATACGTTaa < 2:165737/90‑1 (MQ=255) ctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGGGATGCGGCCGCAGTTTCGCTATACGTTaa > 1:2811697/1‑90 (MQ=255) tgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAAt < 1:758412/90‑1 (MQ=255) gcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAAtt < 2:2187765/90‑1 (MQ=255) cGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAAttt < 1:2337204/90‑1 (MQ=255) cGGGGCCGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAAttt < 2:2925285/90‑1 (MQ=255) ggggCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTc < 2:2356560/90‑1 (MQ=255) gggCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCg < 1:2705840/90‑1 (MQ=255) gggCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCg < 1:2038675/90‑1 (MQ=255) ggctggctGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCTAAGAGATGCGTCCCCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGa > 1:1047751/1‑90 (MQ=255) ctggctgCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGAtt < 1:3239521/90‑1 (MQ=255) gctgCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTNAATTTCGATTaaa < 1:1701392/90‑1 (MQ=255) tgCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGc < 1:2977708/90‑1 (MQ=255) cGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCgg < 2:252140/90‑1 (MQ=255) cGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCgg < 1:1977546/90‑1 (MQ=255) ggCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGt < 2:1947907/90‑1 (MQ=255) ggCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGt < 2:2695725/90‑1 (MQ=255) ccTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtat < 1:2398750/90‑1 (MQ=255) cTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtatt > 2:3414364/1‑90 (MQ=255) tttAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTTTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtattt < 1:2624918/90‑1 (MQ=255) tttAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtattt < 2:3065158/90‑1 (MQ=255) ttAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtattta < 2:177522/90‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTg < 1:598379/90‑1 (MQ=255) cgcgCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTgg < 2:204757/90‑1 (MQ=255) cgcgCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTgg > 2:370431/1‑90 (MQ=255) gcgcCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGgt < 1:1205203/90‑1 (MQ=255) gccgcTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGgtgt > 1:2121304/1‑90 (MQ=255) cgcTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCa < 2:883925/90‑1 (MQ=255) gctggctgTTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCAt < 1:33655/90‑1 (MQ=255) cTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCAtt < 2:103813/90‑1 (MQ=255) cTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCAtt > 2:2284866/1‑90 (MQ=255) tGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTa < 1:1394468/90‑1 (MQ=255) ggCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTAt > 1:316842/1‑90 (MQ=255) ggCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTAt > 1:1595717/1‑90 (MQ=255) cGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGt > 1:2993207/1‑90 (MQ=255) cGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGt < 2:1229773/90‑1 (MQ=255) cGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGt > 1:713366/1‑90 (MQ=255) gggTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTc > 1:995584/1‑90 (MQ=255) gggTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTc < 1:2068711/90‑1 (MQ=255) ggTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCg < 1:718120/90‑1 (MQ=255) ggTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCg < 1:2195198/90‑1 (MQ=255) gTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGa > 2:803492/1‑90 (MQ=255) gTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGa < 1:557252/90‑1 (MQ=255) tATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGAc > 2:3354867/1‑90 (MQ=255) | GCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGAC > AC_000091/175606‑175783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |