| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AC_000091 | 3,350,708 | 0 | A | C | 27.8% | 307.5 / 20.5 | 133 | S725A (TCA→GCA) | arcB | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ArcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/29); new base C (0/37); total (67/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.11e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
AATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAG > AC_000091/3350619‑3350796 | aaTCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGa > 2:901288/1‑90 (MQ=255)aaTCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGa < 2:3347293/90‑1 (MQ=255) tCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAcc < 1:2664269/90‑1 (MQ=255) tCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAcc < 2:2031159/90‑1 (MQ=255) tCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAcc < 1:204702/90‑1 (MQ=255) tCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAcc > 1:2698802/1‑90 (MQ=255) ccATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGCTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAccc > 2:2443369/1‑90 (MQ=255) cATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAcccc < 1:2646885/90‑1 (MQ=255) cATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGAcccc > 2:1498795/1‑90 (MQ=255) aTTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCccg < 2:2561429/90‑1 (MQ=255) ttCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCccgc > 2:708444/1‑90 (MQ=255) ttCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCccgc > 1:1636605/1‑90 (MQ=255) cACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCccgccg < 2:165629/90‑1 (MQ=255) cccGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCcgccgc < 2:3486559/89‑1 (MQ=255) aCCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCcgccgc < 1:1152344/90‑1 (MQ=255) ccGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCa < 1:2948097/90‑1 (MQ=255) gACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCAcc > 1:1226250/1‑90 (MQ=255) aCGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCCCTGACCCCGCCGCACCt < 1:970330/90‑1 (MQ=255) gTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCttt > 2:2211425/1‑90 (MQ=255) tATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTaa > 2:3360190/1‑90 (MQ=255) aTCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAt > 2:1360705/1‑90 (MQ=255) cTTCCCAGGCGGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAAttt < 2:1341362/90‑1 (MQ=255) cTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAttt < 1:2405392/90‑1 (MQ=255) cTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAttt > 1:618691/1‑90 (MQ=255) ttCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAtttt < 1:1880064/90‑1 (MQ=255) ccccAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTCCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTa < 2:2295061/89‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATg > 2:200322/1‑90 (MQ=255) cAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGt < 1:3312573/90‑1 (MQ=255) cAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGt > 2:267900/1‑90 (MQ=255) aGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc < 1:1060685/90‑1 (MQ=255) aGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc < 1:1455378/90‑1 (MQ=255) aGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc < 1:3047981/90‑1 (MQ=255) aGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc < 1:1587894/90‑1 (MQ=255) ggCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcc > 2:2598028/1‑90 (MQ=255) gCCGGAAGGCCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTTTTGCAGATGGGGTAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcct < 2:357035/90‑1 (MQ=255) cGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttc < 1:1217660/90‑1 (MQ=255) ggAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcc > 1:2980550/1‑90 (MQ=255) ggAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcc > 1:847981/1‑90 (MQ=255) ggAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcc > 1:73747/1‑90 (MQ=255) gAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcct < 2:594788/90‑1 (MQ=255) gAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcct > 2:1471279/1‑90 (MQ=255) aaGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTc < 1:2160649/90‑1 (MQ=255) aaGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTc < 2:3160023/90‑1 (MQ=255) aaGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTc > 2:1934824/1‑90 (MQ=255) aGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTca < 1:1972134/90‑1 (MQ=255) gTCAGGAGACTGATTTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaac < 1:3169740/90‑1 (MQ=255) tCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaaca < 2:400262/90‑1 (MQ=255) tCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCGCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaaca > 1:2977974/1‑90 (MQ=255) tCAGGAGACTGAATTGGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaaca < 1:1150022/90‑1 (MQ=255) gagaCTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGc < 2:3039279/90‑1 (MQ=255) agaCTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGcc < 2:2643003/90‑1 (MQ=255) gaCTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCt < 1:130436/90‑1 (MQ=255) gaCTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCt > 2:3277985/1‑90 (MQ=255) aCTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTACTTCCTCAACAATGACtt > 2:650107/1‑90 (MQ=255) tGAATTTGCTGCCCCGGGTGTTGTAGTTGACGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttt < 1:3458464/90‑1 (MQ=255) tGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttt < 1:2943011/90‑1 (MQ=255) tGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttt < 1:2877047/90‑1 (MQ=255) tGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttt < 2:1281415/90‑1 (MQ=255) tGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttt < 2:1535474/90‑1 (MQ=255) gAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCttttt < 2:3123957/90‑1 (MQ=255) aaTTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt < 1:1756424/90‑1 (MQ=255) aTTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTa > 2:2122364/1‑90 (MQ=255) gCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCt > 2:2127235/1‑90 (MQ=255) cTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg < 1:1987601/90‑1 (MQ=255) cTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg < 2:3305502/90‑1 (MQ=255) cTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg > 1:895409/1‑90 (MQ=255) cTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg > 2:3146888/1‑90 (MQ=255) tGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgc > 2:187079/1‑90 (MQ=255) tGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgc > 2:1709677/1‑90 (MQ=255) aCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgcgc < 1:1753398/90‑1 (MQ=255) cccAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGcc > 1:236287/1‑90 (MQ=255) ccAGCTGTTGCAGAGGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCg < 2:1362023/90‑1 (MQ=255) cAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGt < 1:2361026/90‑1 (MQ=255) cAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGt < 2:2470003/90‑1 (MQ=255) cAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGt > 1:2693482/1‑90 (MQ=255) aGCTGTTGCAGATGG‑GTAACCCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTc < 1:1038941/90‑1 (MQ=255) gCTTTTGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCa < 2:3482741/90‑1 (MQ=255) gCTTTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCa < 1:2048802/90‑1 (MQ=255) cTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAg > 1:391358/1‑90 (MQ=255) ttGCAGAGGGCTTAA‑CCCCTCCCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGAtt < 1:3054062/90‑1 (MQ=255) tGCAGATGGCGTAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 2:3106623/90‑1 (MQ=255) tGCAGATGGCGTAC‑CCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 1:1888089/90‑1 (MQ=255) tGCAGATGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 1:79473/90‑1 (MQ=255) tGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc > 2:19273/1‑90 (MQ=255) gCAGGTGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCg < 2:190646/90‑1 (MQ=255) cAGATGGCGTAG‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGa > 1:821917/1‑90 (MQ=255) cAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGa > 2:270591/1‑90 (MQ=255) aGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGAc > 2:74787/1‑90 (MQ=255) aGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGAc > 1:1012766/1‑90 (MQ=255) aTGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTc > 1:2259604/1‑90 (MQ=255) tGGCGTAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTcc < 1:2858348/90‑1 (MQ=255) gggCGTAC‑CCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTcc < 2:1523914/89‑1 (MQ=255) ggCGTAA‑CCCCCCTGGCCCCGCCGCCCCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCa < 2:85088/90‑1 (MQ=255) ggCGTAA‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCa < 1:1536563/90‑1 (MQ=255) gTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCa > 1:3442316/1‑90 (MQ=255) gTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCATTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCa > 1:3393008/1‑90 (MQ=255) ccACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGa > 1:315181/1‑90 (MQ=255) cACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGAc > 1:1264970/1‑90 (MQ=255) aCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACa > 1:2460793/1‑90 (MQ=255) gACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAg > 1:3477264/1‑90 (MQ=255) | AATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAG > AC_000091/3350619‑3350796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |