Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AC_000091 | 3,962,968 | 0 | A | C | 25.0% | 327.0 / 12.5 | 146 | T307P (ACC→CCC) | yhjG | predicted outer membrane biogenesis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/39); new base C (0/36); total (69/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.95e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TGAAGATGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATGGGCGA > AC_000091/3962879‑3963057 | tGAAGATGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATa > 1:2280840/1‑90 (MQ=255) tGAAGATGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATa > 2:1213945/1‑90 (MQ=255) aaGATGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATAcc > 1:390568/1‑90 (MQ=255) aGATGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATAccc > 1:1512576/1‑90 (MQ=255) aTGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCccg < 1:2522273/90‑1 (MQ=255) cGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGtt > 2:94171/1‑90 (MQ=255) tgtCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGa < 1:1847345/90‑1 (MQ=255) gtCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGaa > 2:1546308/1‑90 (MQ=255) tCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCCCTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGaaa < 1:2699042/90‑1 (MQ=255) tCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGaaa < 1:1327946/90‑1 (MQ=255) tCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGaaa > 2:2996656/1‑90 (MQ=255) tCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGaaa < 1:2901054/90‑1 (MQ=255) cGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGGTTGACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGAGTTCTGCTGCCCGATACCCTGCCGTTTGAAAc > 2:1703271/1‑90 (MQ=255) cGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAAc > 1:1096399/1‑90 (MQ=255) cGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAAc > 1:2430536/1‑90 (MQ=255) cGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAAc < 1:1942255/90‑1 (MQ=255) cGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAAc > 2:1103485/1‑90 (MQ=255) gATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACg > 2:196266/1‑90 (MQ=255) aTTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACgg < 1:2108253/90‑1 (MQ=255) tACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATg < 2:1003082/90‑1 (MQ=255) aCGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCTTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATgg < 2:1925268/90‑1 (MQ=255) cGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGt > 1:2795061/1‑90 (MQ=255) cGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGt > 2:985470/1‑90 (MQ=255) ggCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTc > 1:2564968/1‑90 (MQ=255) cTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCgg > 2:155628/1‑90 (MQ=255) aaaTTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTg > 2:2921676/1‑90 (MQ=255) ttttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTa > 2:28723/1‑90 (MQ=255) ttttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTa < 1:2899924/90‑1 (MQ=255) ttttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTa > 2:454454/1‑90 (MQ=255) tttCTGGCGATTCACTGTGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAg < 2:3145058/90‑1 (MQ=255) tttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAg < 1:862638/90‑1 (MQ=255) ttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGc > 1:453973/1‑90 (MQ=255) ttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGc < 1:1250611/90‑1 (MQ=255) ttCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGc < 1:2092055/90‑1 (MQ=255) tCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCg < 2:2266694/90‑1 (MQ=255) cTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGa > 1:1896316/1‑90 (MQ=255) cTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGa > 1:2644821/1‑90 (MQ=255) cTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGa > 2:2164109/1‑90 (MQ=255) cTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGa < 1:1353251/90‑1 (MQ=255) cGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAAt < 2:2592872/90‑1 (MQ=255) cGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAAt > 2:2681404/1‑90 (MQ=255) cGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAAt < 2:2151889/90‑1 (MQ=255) ggttCACTGGGTGGTCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCCGCCCGATCCCCCGCCGCTTGAAACGGATGGCCGGCTGGCAGCGAAAATc < 2:1063313/88‑1 (MQ=255) gATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGGCGGCTGGTAGCGAAAATc > 1:2426036/1‑90 (MQ=255) aaTTCTCTGGGTGACTTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTCCCCAATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATc < 2:3188639/89‑1 (MQ=255) aTTCCCTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCg < 2:1660236/90‑1 (MQ=255) cACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGaca < 1:698876/90‑1 (MQ=255) aCTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGacac > 2:857112/1‑90 (MQ=255) cTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACt > 1:199046/1‑90 (MQ=255) gggTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGa < 2:2966203/90‑1 (MQ=255) gTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGaaa < 2:2720830/90‑1 (MQ=255) gTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGaaa < 2:3479651/90‑1 (MQ=255) tGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGaaaa < 1:2044108/90‑1 (MQ=255) tGATCTCTATGAACTGACGGCCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGaaaa < 2:2767193/90‑1 (MQ=255) gATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGaaaaa > 2:1151408/1‑90 (MQ=255) aTCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAAt < 1:1810299/90‑1 (MQ=255) aTCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACGCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCCGGTCGCGAAAATCGACACTGAAAAAt > 1:3017094/1‑90 (MQ=255) tATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAAtcgtcg < 2:310719/90‑1 (MQ=255) aTGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAACTCGTCgg > 2:1773644/1‑90 (MQ=255) tGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGt > 2:120332/1‑90 (MQ=255) tGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGt > 2:2196229/1‑90 (MQ=255) aCTGACGGGCGTTGTGCTGCCCCATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCtt < 2:796942/90‑1 (MQ=255) aCTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCtt > 2:3378651/1‑90 (MQ=255) cTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCttt < 2:388758/90‑1 (MQ=255) cTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCttt < 1:1115526/90‑1 (MQ=255) tGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTg > 2:1068604/1‑90 (MQ=255) gACGGGCGTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGa < 2:3064888/90‑1 (MQ=255) gACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGa > 2:1556369/1‑90 (MQ=255) aCGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGAt > 2:161304/1‑90 (MQ=255) cGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGAtt > 1:1459594/1‑90 (MQ=255) gggCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTa > 1:3077539/1‑90 (MQ=255) gggCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTa > 1:2395701/1‑90 (MQ=255) cGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATcg < 2:2409827/90‑1 (MQ=255) cGTTCTGCTCCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATcg < 1:818118/90‑1 (MQ=255) gTTCTGCTGCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATcgc < 1:609839/90‑1 (MQ=255) gTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATcgc > 2:2079737/1‑90 (MQ=255) gTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATcgc > 1:1577814/1‑90 (MQ=255) ttCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATcgcg > 1:2747435/1‑90 (MQ=255) tCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCgg > 1:1547177/1‑90 (MQ=255) ctgctgCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGt < 1:1372167/90‑1 (MQ=255) ctgctgCCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGt < 1:1360376/90‑1 (MQ=255) tgctgcCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGtt < 1:2181850/90‑1 (MQ=255) gctgcCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGttt < 1:1622683/90‑1 (MQ=255) gctgcCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGttt < 1:337558/90‑1 (MQ=255) gctgcCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGttt < 1:1707527/90‑1 (MQ=255) gctgcCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGttt < 1:2248995/90‑1 (MQ=255) ctgcCCGATGCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGtttt < 2:2425132/90‑1 (MQ=255) ctgcCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGtttt > 2:3227782/1‑90 (MQ=255) tgcCCGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTa < 1:1335281/90‑1 (MQ=255) cccGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAGAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAAt > 2:1326028/1‑90 (MQ=255) cccGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATAGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAAt > 1:1827986/1‑90 (MQ=255) ccGATTCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATg < 2:1922968/90‑1 (MQ=255) cGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATgg < 1:2164144/90‑1 (MQ=255) cGATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATgg < 1:323904/90‑1 (MQ=255) cGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATgg > 2:2185979/1‑90 (MQ=255) gATCCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATggg < 2:1397605/90‑1 (MQ=255) gATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATggg > 2:1382202/1‑90 (MQ=255) aTACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATGGGc < 2:2068776/90‑1 (MQ=255) tACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATGGGCg < 1:1614910/90‑1 (MQ=255) aCCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATGGGCGa < 1:2877020/90‑1 (MQ=255) | TGAAGATGGGCGGTGTCGATTTACGGCTTAAATTTTCTGGCGATTCACTGGGTGATCTCTATGAACTGACGGGCGTTCTGCTGCCCGATACCCCGCCGTTTGAAACGGATGGTCGGCTGGTAGCGAAAATCGACACTGAAAAATCGTCGGTCTTTGATTATCGCGGTTTTAATGGGCGA > AC_000091/3962879‑3963057 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |