Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AC_000091 | 4,051,195 | C→T | R270C (CGT→TGT) | ugpE → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AC_000091 | 4,051,195 | 0 | C | T | 98.4% | 484.7 / ‑5.6 | 124 | R270C (CGT→TGT) | ugpE | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base T (45/77); total (45/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.34e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTA > AC_000091/4051108‑4051280 | ggCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAgtgt > 1:2712151/1‑90 (MQ=255) gCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGtgtg < 2:3266301/90‑1 (MQ=255) gCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGtgtg < 2:2288244/90‑1 (MQ=255) cGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGc < 2:2729478/90‑1 (MQ=255) cGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGc > 1:713883/1‑90 (MQ=255) gAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGcc < 1:1176062/90‑1 (MQ=255) aaGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCt > 2:3351365/1‑90 (MQ=255) ggCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTc < 1:1173129/90‑1 (MQ=255) ggCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTc < 1:3150904/90‑1 (MQ=255) accacGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTg > 2:2727016/1‑90 (MQ=255) cacGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTgcg < 1:130856/90‑1 (MQ=255) acGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTgcgc > 1:1940313/1‑90 (MQ=255) cGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGcgcg < 1:3031509/90‑1 (MQ=255) cGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGcgcg < 1:1565641/90‑1 (MQ=255) gAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGc < 1:460605/90‑1 (MQ=255) gAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGGGCGCGGc > 2:937592/1‑90 (MQ=255) aTGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCt < 1:1797385/90‑1 (MQ=255) aTGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCt < 1:1675620/90‑1 (MQ=255) aTGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCt < 1:2549026/90‑1 (MQ=255) tGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTg > 2:1004868/1‑90 (MQ=255) ggAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTgg > 2:3249086/1‑90 (MQ=255) aaCTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTc < 2:1180933/90‑1 (MQ=255) cTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGa > 2:2107513/1‑90 (MQ=255) cTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGa > 1:788082/1‑90 (MQ=255) tCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGAt < 1:1214939/90‑1 (MQ=255) tCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGAt > 1:3291629/1‑90 (MQ=255) tCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGAt < 2:1420346/90‑1 (MQ=255) cAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATa < 1:644618/90‑1 (MQ=255) cAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATa < 1:3446108/90‑1 (MQ=255) cAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATa > 1:3188825/1‑90 (MQ=255) cAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATa < 2:864242/90‑1 (MQ=255) aGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAg < 1:1130462/90‑1 (MQ=255) aGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAg > 1:1990906/1‑90 (MQ=255) gTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGt < 1:3386384/90‑1 (MQ=255) gATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTga < 2:3275986/90‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTgag > 2:1875938/1‑90 (MQ=255) tggtggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTgaga > 2:2862886/1‑90 (MQ=255) tggtggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTgaga < 2:2679855/90‑1 (MQ=255) tggtggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTgaga < 2:1222343/90‑1 (MQ=255) ggtggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGaa > 1:1201194/1‑90 (MQ=255) gtggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGaaa < 1:2961655/90‑1 (MQ=255) tggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAAt > 2:2550018/1‑90 (MQ=255) tggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAAt < 2:425540/90‑1 (MQ=255) tggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAAt < 2:930937/90‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATa > 1:3048831/1‑90 (MQ=255) gCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATaa < 1:671415/90‑1 (MQ=255) gCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATaa < 1:701601/90‑1 (MQ=255) gATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGa < 1:784439/90‑1 (MQ=255) gATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGa < 2:1031007/90‑1 (MQ=255) gATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGa > 1:2485341/1‑90 (MQ=255) gATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGa > 2:3412464/1‑90 (MQ=255) tgttgtTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATg > 2:3306467/1‑90 (MQ=255) gttgttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATgg < 1:1298805/90‑1 (MQ=255) gttgttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATgg < 1:1708578/90‑1 (MQ=255) ttgttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGc > 2:1770547/1‑90 (MQ=255) tgttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCa > 2:382780/1‑90 (MQ=255) gttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAg < 2:1052300/90‑1 (MQ=255) gttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAg < 1:413035/90‑1 (MQ=255) gttAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAg < 2:1748670/90‑1 (MQ=255) tAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGa < 1:819801/90‑1 (MQ=255) tAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGa > 1:291066/1‑90 (MQ=255) aCGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACt < 1:2996571/90‑1 (MQ=255) aCGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACt > 1:2237885/1‑90 (MQ=255) aCGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACt < 1:2983937/90‑1 (MQ=255) aCGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACt > 1:428767/1‑90 (MQ=255) cGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTg < 2:3283665/90‑1 (MQ=255) gCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGCGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGa < 2:2280243/90‑1 (MQ=255) cTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGaa > 2:294103/1‑90 (MQ=255) cTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGaa < 1:2178035/90‑1 (MQ=255) tATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAAt < 2:1526840/90‑1 (MQ=255) aTCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAAtt < 1:1371169/90‑1 (MQ=255) aTCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAAtt > 1:2480592/1‑90 (MQ=255) aTCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCACGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAAtt < 2:1897481/90‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTAc < 1:1268166/90‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTAc > 2:196225/1‑90 (MQ=255) cccACCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTAc < 2:2805699/90‑1 (MQ=255) ccTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACa < 2:1238501/90‑1 (MQ=255) cTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAg < 1:1418055/90‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGATAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAgg < 2:186126/90‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAgg < 2:244948/90‑1 (MQ=255) ggtggtGATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAg > 1:1636439/1‑90 (MQ=255) gtggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGt < 1:325602/90‑1 (MQ=255) gtggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGt > 2:1494488/1‑90 (MQ=255) tggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTa < 2:2534434/90‑1 (MQ=255) tggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTa > 1:3171639/1‑90 (MQ=255) tggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTa < 2:1875870/90‑1 (MQ=255) ggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATNGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTaa > 2:2282578/1‑90 (MQ=255) ggtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTaa > 1:1127142/1‑90 (MQ=255) gtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAAc < 1:2961259/90‑1 (MQ=255) gtgATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAAc > 2:1787699/1‑90 (MQ=255) gATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCa < 2:1114998/90‑1 (MQ=255) gATTGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCa < 2:3465788/90‑1 (MQ=255) tGTTTTAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCaaaa < 2:1995596/90‑1 (MQ=255) tttAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCt < 2:416588/90‑1 (MQ=255) tAGTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTgg > 1:1832766/1‑90 (MQ=255) gTGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGa < 2:2601336/90‑1 (MQ=255) tGATGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGAt > 1:1217999/1‑90 (MQ=255) aTGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATgg < 1:994998/90‑1 (MQ=255) aTGCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATgg < 2:1939249/90‑1 (MQ=255) gCAGTGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTa < 2:2870217/90‑1 (MQ=255) | GGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTGCGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTA > AC_000091/4051108‑4051280 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |