| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 611,351 | Δ1 bp | coding (1739/3882 nt) | entF → | enterobactin non‑ribosomal peptide synthetase EntF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 611,348 | 0 | C | . | 100.0% | 101.2 / NA | 23 | coding (1736/3882 nt) | entF | enterobactin non‑ribosomal peptide synthetase EntF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (11/12); total (11/12) | |||||||||||
AAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCT > NZ_CP009273/611258‑611428 | aaGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGc < 2:560019/91‑1 (MQ=255) aGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGcc < 2:786426/91‑1 (MQ=255) cgtccgtcGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTac > 1:13052/1‑91 (MQ=255) cgtccgtcGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTac < 2:389684/91‑1 (MQ=255) acagcgacgaTTAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGcgccg > 1:37151/5‑91 (MQ=255) accGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCt > 2:50703/1‑91 (MQ=255) accGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCt > 1:247266/1‑91 (MQ=255) acgaTCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCaa < 1:38211/91‑1 (MQ=255) gCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAAc < 2:22721/91‑1 (MQ=255) gcgcTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGc > 1:634907/1‑91 (MQ=255) gcgcTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGc > 2:478779/1‑91 (MQ=255) aGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCacac < 1:419704/91‑1 (MQ=255) gATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGc < 1:834051/91‑1 (MQ=255) aTGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCt < 1:804133/91‑1 (MQ=255) aTGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCt < 1:193200/91‑1 (MQ=255) gTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTta > 1:101445/1‑91 (MQ=255) cccAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTatat < 2:368041/91‑1 (MQ=255) cccAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTatat < 1:20731/91‑1 (MQ=255) tAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCttt < 1:289818/91‑1 (MQ=255) tAACAAGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCttt > 2:685997/1‑91 (MQ=255) aGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGc < 2:250654/63‑1 (MQ=255) aGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGc > 1:250654/1‑63 (MQ=255) aGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCacac > 2:138581/1‑70 (MQ=255) aGCCTTTGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCacac < 1:138581/70‑1 (MQ=255) ttGCTATAACG‑CCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCt > 1:118840/1‑91 (MQ=255) | AAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCT > NZ_CP009273/611258‑611428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |