Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 209,618 | A→C | A267A (GCA→GCC) | tilS → | tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 209,618 | 0 | A | C | 100.0% | 77.1 / NA | 22 | A267A (GCA→GCC) | tilS | tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (5/17); total (5/17) |
GGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGC > NZ_CP009273/209532‑209705 | gggACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGa < 1:54865/91‑1 (MQ=255) tgCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGAcgc > 1:223473/1‑91 (MQ=255) ccAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGt < 1:561997/91‑1 (MQ=255) ccAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGt < 1:811841/91‑1 (MQ=255) cAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGtt < 2:455477/91‑1 (MQ=255) cAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGtt < 2:395583/91‑1 (MQ=255) gCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTg < 2:275885/91‑1 (MQ=255) cTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGa < 1:312617/91‑1 (MQ=255) tGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAg > 1:92561/1‑91 (MQ=255) tGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAg > 2:217656/1‑91 (MQ=255) ggCGATGAGTGATCCCCGCCGCGGGGCGAGTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTTAgg < 2:269110/91‑1 (MQ=255) gAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGATGATCTgg > 2:766152/1‑91 (MQ=255) aTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGa > 2:814010/1‑91 (MQ=255) cgcgcgGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtggcgc < 2:328570/91‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtggcgc < 2:570127/91‑1 (MQ=255) cgATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGcgcg < 2:745809/91‑1 (MQ=255) tCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGa < 1:332183/91‑1 (MQ=255) gctggcAGGGCAGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCAccc < 1:622571/91‑1 (MQ=255) cagAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGtt < 1:612540/91‑1 (MQ=255) cagAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGtt < 1:6083/91‑1 (MQ=255) tGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGgc < 2:623984/91‑1 (MQ=255) tGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGgc < 2:97496/91‑1 (MQ=255) | GGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGC > NZ_CP009273/209532‑209705 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |