Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,900,350 | A→G | T136A (ACC→GCC) | mntP → | manganese efflux pump MntP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,900,350 | 0 | A | G | 100.0% | 72.6 / NA | 20 | T136A (ACC→GCC) | mntP | manganese efflux pump MntP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (8/12); total (8/12) |
CTACTGGTAACCACCGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCT > NZ_CP009273/1900263‑1900422 | cTACTGGTAACCACCGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCg > 2:224469/1‑91 (MQ=255) cTGGTAACCACCGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCAt < 1:742494/91‑1 (MQ=255) tGGTAACCACCGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCAtt < 2:196877/91‑1 (MQ=255) caccGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCAtt < 1:629968/91‑1 (MQ=255) ccGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTgg > 2:327762/1‑91 (MQ=255) ccGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTgg > 1:418220/1‑91 (MQ=255) tGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCAtt > 2:516872/1‑75 (MQ=255) tGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCAtt < 1:516872/75‑1 (MQ=255) gCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGAt > 2:252668/1‑91 (MQ=255) aTGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTCTGCAACCTTGATTATGTc < 1:822795/91‑1 (MQ=255) tGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCa < 2:99392/91‑1 (MQ=255) tGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCa < 1:327762/91‑1 (MQ=255) tGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCa < 1:224469/91‑1 (MQ=255) gtTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCa < 2:140394/49‑1 (MQ=255) gtTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCa > 1:140394/1‑49 (MQ=255) gtTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGAtgg > 1:682559/1‑91 (MQ=255) gTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGAtggttgg < 2:279558/91‑1 (MQ=255) ccTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATc < 1:252668/91‑1 (MQ=255) ccTGCAGGTCAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATc < 2:418220/91‑1 (MQ=255) cAGGACAACATTATCGCGGCCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCt > 1:700535/1‑91 (MQ=255) | CTACTGGTAACCACCGCGATTGCCACCAGCCTGGATGCCATGGCTGTGGGTGTTGGTCTTGCTTTCCTGCAGGTCAACATTATCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCT > NZ_CP009273/1900263‑1900422 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |