| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,776,541 | T→G | V297G (GTG→GGG) | ydiS → | FAD‑dependent oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,776,541 | 0 | T | G | 100.0% | 41.4 / NA | 13 | V297G (GTG→GGG) | ydiS | FAD‑dependent oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (8/5); total (8/5) | |||||||||||
TTTAAACAACACCCCGCCATTCGCCCGCTGATTAGCGGCGGCAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGTGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCATCGGCTCAGGCTGCCGCCACAACGGTGATCGCCGCCAAAGAACGCGCGGATTTCTCCGC > NZ_CP009273/1776423‑1776676 | tttAAACAACACCCCGCCATTCGCCCGCTGATTAGCGGCGGCAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGAcgccg > 2:209705/1‑139 (MQ=255) cacCCCGCCATTCGCCCGCTGATTAGCGGCGGCAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCt > 2:413131/1‑139 (MQ=255) cGCCCGCTGATTAGCGGCGGCAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTgg > 1:394377/1‑139 (MQ=255) ggcAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCa < 1:209705/139‑1 (MQ=255) ggcAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCa < 1:413131/139‑1 (MQ=255) ttCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGAtt > 1:348607/1‑128 (MQ=255) ttCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGAtt < 2:348607/128‑1 (MQ=255) aaGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCATCGGCTCAGGCTGCCGCca > 2:70571/1‑138 (MQ=255) cGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCAt > 1:1517/1‑116 (MQ=255) cGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCAt < 2:1517/116‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCATCGGCTCAGGCTGCCGCCACAACg > 2:387251/1‑139 (MQ=255) gCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCATCGGCTCAGGCTGCCGCCACAACGGTGATcg < 2:394377/139‑1 (MQ=255) gCGGGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCATCGGCTCAGGCTGCCGCCACAACGGTGATCGCCGCCAAAGAACGCGCGGATTTCTCCGc > 2:46675/1‑139 (MQ=255) | TTTAAACAACACCCCGCCATTCGCCCGCTGATTAGCGGCGGCAAACTGCTTGAATATTCCGCGCATATGGTGCCGGAAGGCGGTCTGGCAATGGTGCCGCAACTGGTTAACGAGGGCGTGATGATCGTTGGTGACGCCGCAGGCTTCTGCCTGAATTTGGGTTTTACGGTCCGCGGCATGGATTTAGCCATTGCATCGGCTCAGGCTGCCGCCACAACGGTGATCGCCGCCAAAGAACGCGCGGATTTCTCCGC > NZ_CP009273/1776423‑1776676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |