Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 2,066,165 | A→G | G382G (GGA→GGG) | agn43 → | autotransporter adhesin Ag43 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,066,165 | 0 | A | G | 100.0% | 90.4 / NA | 26 | G382G (GGA→GGG) | agn43 | autotransporter adhesin Ag43 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (15/11); total (15/11) |
AAGCTGATAATGTCGTACTGGAAAATGGCGGACGCCTGGATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGAAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAGGCAGTTCATTCACGCTGAACGCC > NZ_CP009273/2066029‑2066300 | aaGCTGATAATGTCGTACTGGAAAATGGCGGACGCCTGGATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGgaa < 1:724046/139‑1 (MQ=255) aTGTCGTACTGGAAAATGGCGGACGCCTGGATGTGCTGACCGGACACACAGCCATTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGgtgt < 2:178448/139‑1 (MQ=255) gAAAATGGCGGACGCCTGGATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGcc > 1:119921/1‑138 (MQ=255) tGGATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGt > 1:85252/1‑139 (MQ=255) gATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGt < 2:85252/137‑1 (MQ=255) gATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCa < 2:119921/139‑1 (MQ=255) tgtgCTGCCCGGACACACAGCCACTAATTCCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCTGTGCCGCTGTCAGt < 1:415163/139‑1 (MQ=255) gCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGt < 1:303168/132‑1 (MQ=255) gCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGt > 2:303168/1‑132 (MQ=255) cTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTa > 2:342671/1‑139 (MQ=255) aCCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTAccc > 2:450794/1‑139 (MQ=255) aCCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTAccc > 1:741525/1‑139 (MQ=255) acacacAGCCACTAATGCCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGc < 1:846194/139‑1 (MQ=255) caGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCg < 2:127406/114‑1 (MQ=255) caGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACAGCTGGCCGATTCCGGTGCCg > 1:127406/1‑114 (MQ=255) gCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGa > 2:654057/1‑138 (MQ=255) aCTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATgg < 1:272705/80‑1 (MQ=255) aCTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATgg > 2:272705/1‑80 (MQ=255) aCCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCAtt > 2:267763/1‑137 (MQ=255) ccGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGGGCGGCGGAAAGGCATTCAg > 2:371341/1‑138 (MQ=255) aaCGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCg > 1:483611/1‑139 (MQ=255) tGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTg < 2:77825/139‑1 (MQ=255) cAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTg < 1:620446/139‑1 (MQ=255) gCACCGCCACCACCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAgg < 2:741525/139‑1 (MQ=255) ccaccaCCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAGGCAGtt > 1:162444/1‑138 (MQ=255) ccaccaCCGTATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAGGCAGtt > 1:646037/1‑138 (MQ=255) tATCCATGGGGAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAGGCAGTTCATTCACGCt > 2:50073/1‑139 (MQ=255) ggggAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAGGCAGTTCATTCACGCTGAACGcc > 1:275015/1‑139 (MQ=255) | AAGCTGATAATGTCGTACTGGAAAATGGCGGACGCCTGGATGTGCTGACCGGACACACAGCCACTAATACCCGCGTGGATGATGGCGGAACGCTGGATGTCCGCAACGGTGGCACCGCCACCACCGTATCCATGGGAAATGGCGGTGTACTGCTGGCCGATTCCGGTGCCGCTGTCAGTGGTACCCGGAGCGACGGAAAGGCATTCAGTATCGGAGGCGGTCAGGCGGATGCCCTGATGCTGGAAAAAGGCAGTTCATTCACGCTGAACGCC > NZ_CP009273/2066029‑2066300 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |