| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,347,385 | T→G | P420P (CCT→CCG) | glpA → | anaerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,347,385 | 0 | T | G | 87.9% | 191.6 / 19.3 | 66 | P420P (CCT→CCG) | glpA | anaerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/5); new base G (28/30); total (31/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.11e-05 | |||||||||||
ACACGCGCCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTG > NZ_CP009273/2347249‑2347520 | acacGCGCCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACgccggc < 2:433481/139‑1 (MQ=255) gcCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACgccggc < 2:849658/133‑1 (MQ=255) gcCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACgccggc > 1:849658/1‑133 (MQ=255) gcCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCt > 2:256684/1‑139 (MQ=255) cTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCg > 1:223833/1‑139 (MQ=255) cTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCg > 2:745192/1‑139 (MQ=255) cTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCg > 2:664066/1‑139 (MQ=255) cTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCg > 2:622774/1‑139 (MQ=255) cTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCg > 2:201717/1‑139 (MQ=255) gCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTc > 1:521377/1‑139 (MQ=255) ccGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCt < 1:651262/139‑1 (MQ=255) gCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCa < 1:234662/134‑1 (MQ=255) gCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCAcc < 1:556762/136‑1 (MQ=255) cTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGcc < 2:468223/139‑1 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTg < 2:584469/126‑1 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTg > 1:584469/1‑126 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTgg > 1:848276/1‑139 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTg < 1:527353/138‑1 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTg < 1:201717/138‑1 (MQ=255) aaGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTg > 1:20755/1‑139 (MQ=255) aGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGc < 1:256684/139‑1 (MQ=255) aaCCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGa < 2:239730/139‑1 (MQ=255) aaCCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGa < 1:723639/139‑1 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAg < 1:227850/103‑1 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAg > 2:227850/1‑103 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGcc > 2:749805/1‑121 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGcc < 1:749805/121‑1 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGa < 2:291335/137‑1 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGa > 1:291335/1‑137 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAg > 1:460808/1‑139 (MQ=255) tGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGGGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAg > 2:799621/1‑114 (MQ=255) tGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGGGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAg < 1:799621/114‑1 (MQ=255) ccTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCgg < 2:20755/138‑1 (MQ=255) gCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAg > 1:742024/1‑102 (MQ=255) gCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAg < 2:742024/102‑1 (MQ=255) gCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTg < 1:465278/137‑1 (MQ=255) cGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAg > 1:684331/1‑139 (MQ=255) tAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTg < 1:496129/139‑1 (MQ=255) aGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAg > 2:320581/1‑139 (MQ=255) aGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAg > 2:476186/1‑139 (MQ=255) tctcCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTg < 1:710129/126‑1 (MQ=255) tctcCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTg > 2:710129/1‑126 (MQ=255) ccccGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAAtt > 1:607951/1‑138 (MQ=255) ccccGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTCTGTGAGTGc > 1:491593/1‑95 (MQ=255) ccccGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGc < 2:491593/95‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTaaa < 1:581297/139‑1 (MQ=255) tGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGt > 1:779293/1‑79 (MQ=255) tGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGt < 2:779293/79‑1 (MQ=255) tGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGaa > 1:505336/1‑110 (MQ=255) tGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGaa < 2:505336/110‑1 (MQ=255) tGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGt > 1:40852/1‑139 (MQ=255) ttCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGCAGAAAATTTAAACGGTAATAGc > 2:650824/1‑139 (MQ=255) cTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCct > 1:658929/1‑139 (MQ=255) cGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCctgc < 2:40852/138‑1 (MQ=255) tATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAg > 2:294890/1‑40 (MQ=255) tATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAg < 1:294890/40‑1 (MQ=255) tATCGTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGAtt > 2:515551/1‑139 (MQ=255) gTCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACg < 1:664066/139‑1 (MQ=255) tCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGc < 2:521377/139‑1 (MQ=255) tCATGGCGATCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGc < 2:427837/139‑1 (MQ=255) tGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCcgt > 1:72847/1‑139 (MQ=255) gATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTa < 2:607951/139‑1 (MQ=255) aTCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTAc < 2:639420/139‑1 (MQ=255) aTCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTg < 1:819421/78‑1 (MQ=255) aTCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTg > 2:819421/1‑78 (MQ=255) aTCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTAc < 2:291526/139‑1 (MQ=255) aTCGCACGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTAc < 2:133607/139‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCgtg < 1:60551/139‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCgtg < 1:515551/139‑1 (MQ=255) gccggcctGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGtgtg < 1:476186/139‑1 (MQ=255) | ACACGCGCCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTG > NZ_CP009273/2347249‑2347520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |