Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 2,891,751 | T→G | T343P (ACC→CCC) | ygcU ← | FAD‑binding oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,891,751 | 0 | T | G | 100.0% | 115.2 / NA | 33 | T343P (ACC→CCC) | ygcU | FAD‑binding oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (17/16); total (17/16) |
GAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGTTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAATCCCTTCGCC > NZ_CP009273/2891618‑2891886 | gAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGgttt > 2:544180/1‑137 (MQ=255) aaTGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTGCGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAg < 2:157774/139‑1 (MQ=255) aTGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAgg < 2:625189/139‑1 (MQ=255) aTGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAgg < 2:39951/139‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTACATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGca > 1:38488/1‑138 (MQ=255) cATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGt > 2:578620/1‑139 (MQ=255) tGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGc < 1:154017/139‑1 (MQ=255) tGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGc > 2:570256/1‑139 (MQ=255) ggCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGGCACttt < 1:172444/138‑1 (MQ=255) ggAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTACATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTcc < 2:38488/139‑1 (MQ=255) gAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTccc < 2:274416/139‑1 (MQ=255) gTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCa < 2:198484/139‑1 (MQ=255) tACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAg > 2:830639/1‑139 (MQ=255) cGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAgg < 1:830639/138‑1 (MQ=255) ttAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAAcc < 1:544180/139‑1 (MQ=255) aataaCGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAg > 1:395581/1‑139 (MQ=255) gCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTc > 2:104844/1‑138 (MQ=255) tCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGAt > 2:223631/1‑137 (MQ=255) tCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGAt > 1:109766/1‑137 (MQ=255) gATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTg < 1:512791/139‑1 (MQ=255) gATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTg < 1:104844/139‑1 (MQ=255) cagcagCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCa < 1:577356/137‑1 (MQ=255) cagcCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCg > 2:617851/1‑139 (MQ=255) ccGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCggg > 1:499230/1‑138 (MQ=255) aaGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTg < 2:258850/96‑1 (MQ=255) aaGCCCATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTg > 1:258850/1‑96 (MQ=255) cccATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCaa > 2:831822/1‑139 (MQ=255) ccATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAAt > 1:117921/1‑139 (MQ=255) cATGTTGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAATc > 2:675860/1‑139 (MQ=255) ttGCCGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAATCCCtt < 1:223631/139‑1 (MQ=255) ccGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCg > 2:436968/1‑43 (MQ=255) ccGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCg < 1:436968/43‑1 (MQ=255) ccGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAATCCCTTCGc > 2:93229/1‑139 (MQ=255) cGGGTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAATCCCTTCGcc > 1:57268/1‑139 (MQ=255) | GAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATACGGTTAATAACGCTTTCGTAGATTTCGTGGATGCAGCTCCAGCAGCCGGATACTTCGGTGGTAAAGCCCATGTTGCCGGTTTTGAGGATCTGCACACGTTCGGCAGCCACTTTATCCGGTCCCCAGTTCAGGTTGTTAAACCAGGTTTCGATCAGCTTGCTGTCCACGCGCTGGCATTGCGGGTAGCGGGCAACGATTTCCGCAATCCCTTCGCC > NZ_CP009273/2891618‑2891886 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |