Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,202,275 | T→G | V298G (GTG→GGG) | ttdT → | L‑tartrate/succinate antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,202,275 | 0 | T | G | 100.0% | 173.8 / NA | 48 | V298G (GTG→GGG) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (26/22); total (26/22) |
TACCCGCCGGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGTGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCT > NZ_CP009273/3202154‑3202409 | tccccGCCGGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcg < 1:757675/137‑1 (MQ=255) tACCCGCCGGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcg < 2:655330/139‑1 (MQ=255) tACCCGCCGGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcg > 1:678108/1‑139 (MQ=255) tACCCGCCGGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggc < 1:494386/138‑1 (MQ=255) cgGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATta > 1:318376/1‑139 (MQ=255) tGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcgg < 1:247515/120‑1 (MQ=255) tGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcgg > 2:247515/1‑120 (MQ=255) tGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCcgc > 1:631606/1‑138 (MQ=255) gCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGa < 2:678108/138‑1 (MQ=255) cGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATg < 2:631606/139‑1 (MQ=255) cAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCg > 1:188718/1‑139 (MQ=255) aGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCgg > 2:406134/1‑139 (MQ=255) aGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCgg > 1:779436/1‑139 (MQ=255) cgcTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCg > 2:677869/1‑139 (MQ=255) ggCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCgtgg < 2:652517/137‑1 (MQ=255) ggCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCgtgg < 1:122247/137‑1 (MQ=255) agaCGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACt > 1:790420/1‑139 (MQ=255) gAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACCGCGTGGTGGCACTGAtgc > 2:220681/1‑139 (MQ=255) gAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgc > 2:788344/1‑139 (MQ=255) gAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgc < 2:513454/139‑1 (MQ=255) gAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgc > 1:40835/1‑139 (MQ=255) aaCTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 1:788344/139‑1 (MQ=255) cAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCa < 2:157387/126‑1 (MQ=255) cAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCa > 1:157387/1‑126 (MQ=255) cAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTc > 2:703169/1‑139 (MQ=255) aGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCt > 1:54196/1‑139 (MQ=255) ctctGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATg > 2:149383/1‑90 (MQ=255) ctctGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATg < 1:149383/90‑1 (MQ=255) ttCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGa > 2:252775/1‑83 (MQ=255) ttCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGa < 1:252775/83‑1 (MQ=255) ttCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 2:41755/1‑139 (MQ=255) gTGAAAATCGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCa < 1:277963/101‑1 (MQ=255) gTGAAAATCGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCa > 2:277963/1‑101 (MQ=255) tGAAAAGCGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTGCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt < 1:283005/139‑1 (MQ=255) aaaaaCGGATGCTGGGGCTGATGGTAGGGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt < 1:180973/138‑1 (MQ=255) aaaaaCGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcg < 1:634438/54‑1 (MQ=255) aaaaaCGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTcggcg > 2:634438/1‑54 (MQ=255) ggggCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAgcg > 2:157971/1‑139 (MQ=255) aTGGTA‑GGCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGa < 1:546104/139‑1 (MQ=255) ggCGCGCTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGtt < 2:392379/138‑1 (MQ=255) cgcTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTc > 2:98248/1‑110 (MQ=255) cgcTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTc < 1:98248/110‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCcg > 2:66179/1‑40 (MQ=255) cTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCcg < 1:66179/40‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt < 2:579068/107‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt > 1:579068/1‑107 (MQ=255) cTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTtcttct > 2:554619/1‑139 (MQ=255) cTGGGGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTtcttct > 1:812165/1‑139 (MQ=255) | TACCCGCCGGTACTGAAGTCTGGCGATCAGGTGCCGCGCTGGGCAGAGACGGAACTGCAGGCAATGGGCCCGCTCTGTTCGCGTGAAAAACGGATGCTGGGGCTGATGGTA‑GGCGCGCTGGTGCTGTGGATTTTCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCT > NZ_CP009273/3202154‑3202409 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |