| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 4,064,260 | A→C | V286G (GTG→GGG) | yihS ← | sulfoquinovose isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 4,064,260 | 0 | A | C | 100.0% | 285.1 / NA | 82 | V286G (GTG→GGG) | yihS | sulfoquinovose isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (42/40); total (42/40) | |||||||||||
TAGAGCGCGTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCACGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAGTGGCCTGGTGTACCTCCGAACG > NZ_CP009273/4064131‑4064395 | tAGAGCGCGTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCg < 1:479089/138‑1 (MQ=255)tAGAGCGCGTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCg < 1:391832/138‑1 (MQ=255) gcgcGTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTaaa > 2:450596/1‑139 (MQ=255) gcgTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACa < 2:665093/139‑1 (MQ=255) cgTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTaaa > 2:691063/1‑136 (MQ=255) cgTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAg < 2:240541/139‑1 (MQ=255) cgTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGAGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGGATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGAGGCGTTaaa > 2:772056/1‑136 (MQ=255) gTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGa > 2:389560/1‑139 (MQ=255) tACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGTCGTTAAACAGACCTTTgg < 2:428211/138‑1 (MQ=255) tACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTgg > 1:428211/1‑138 (MQ=255) aCCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGAGGCGTTAAACAGACCTTTGGCa > 1:572134/1‑139 (MQ=255) cccATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCa < 2:445034/138‑1 (MQ=255) cccATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCAt < 1:782577/139‑1 (MQ=255) gCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCAtcttc > 1:468935/1‑137 (MQ=255) gacgaTAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTagcag < 1:589280/138‑1 (MQ=255) aTAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATg > 1:155050/1‑139 (MQ=255) ggCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCtg > 2:106341/1‑139 (MQ=255) gCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCtgg < 2:155050/139‑1 (MQ=255) cgcgGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACg > 1:413384/1‑139 (MQ=255) gcgGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACgg < 2:726123/139‑1 (MQ=255) cgGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACggg > 1:313814/1‑139 (MQ=255) cgGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACggg > 1:469979/1‑139 (MQ=255) ccGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCgg > 1:232343/1‑72 (MQ=255) ccGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCgg < 2:232343/72‑1 (MQ=255) ccGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAg > 1:620879/1‑139 (MQ=255) ggTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAggg < 2:189540/139‑1 (MQ=255) ttccttccCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGgcag > 2:625135/1‑138 (MQ=255) tccCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGTCAGCATGGa > 2:489688/1‑139 (MQ=255) cAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTaaa > 2:263683/1‑68 (MQ=255) cAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTaaa < 1:263683/68‑1 (MQ=255) cAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAggg < 1:860036/127‑1 (MQ=255) cAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAggg > 2:860036/1‑127 (MQ=255) aGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGAtgtg < 1:255419/139‑1 (MQ=255) aGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGAtgtg < 1:625135/139‑1 (MQ=255) aaaCAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTACACg > 2:450078/1‑139 (MQ=255) aaaCAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACg > 2:669901/1‑139 (MQ=255) cAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGcc < 2:468935/139‑1 (MQ=255) cAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGcc < 1:859132/139‑1 (MQ=255) aTCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCATCATGGATGTGCAGCATTAAACGGccc > 1:503410/1‑138 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTag > 1:614272/1‑70 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTag < 2:614272/70‑1 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGgcagca > 1:553608/1‑113 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGgcagca < 2:553608/113‑1 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCa > 1:172163/1‑139 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCa > 1:197793/1‑139 (MQ=255) tCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCa > 2:384306/1‑139 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTg > 2:773965/1‑40 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTg < 1:773965/40‑1 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTc < 1:31430/102‑1 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTc > 2:31430/1‑102 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCAt > 2:157592/1‑139 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCAt > 1:65984/1‑139 (MQ=255) cccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCAt > 2:827962/1‑139 (MQ=255) ccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCAtt < 2:197793/139‑1 (MQ=255) ccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCAtt < 2:65984/139‑1 (MQ=255) ccGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCAtt < 1:827962/139‑1 (MQ=255) gTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGGCCCTTTCg < 2:763051/139‑1 (MQ=255) tCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGa > 1:696318/1‑139 (MQ=255) cgcCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGAtgtg < 2:622223/112‑1 (MQ=255) cgcCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGAtgtg > 1:622223/1‑112 (MQ=255) gcCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAg < 1:59170/139‑1 (MQ=255) gcCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAg < 2:60201/139‑1 (MQ=255) 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cgcgCCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCACCATTCGATCCAGTGGCATGGTGAATCTACGaa > 2:136737/1‑139 (MQ=255) gcgcCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAGTGGcc < 2:641079/123‑1 (MQ=255) gcgcCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAGTGGcc > 1:641079/1‑123 (MQ=255) cgcCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTaaa > 1:390790/1‑99 (MQ=255) cgcCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTaaa < 2:390790/99‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAGTGGCCTGGTGTACCTCCGAAcg > 1:594331/1‑139 (MQ=255) | TAGAGCGCGTAGGCCGTACCCATTGCTTCGACGATAGGCCAACGTACACGTTCGCGGACCACCGGTTTTCCTTCCCAGTCAACGGTATAAACAATCCCGTCCGCGCCATCGGGTGCCCAGGCATCGCGCACGGTGGCGTTAAACAGACCTTTGGCATCTTCTAGCAGCCATGCTGGTGGTTGTTCGCAACGGGCTTCCAGGGCAGCATGGATGTGCAGCATTAAACGGCCCCATTCGATCCAGTGGCCTGGTGTACCTCCGAACG > NZ_CP009273/4064131‑4064395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |