Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 4,568,721 | A→G | I145T (ATC→ACC) | mcrB ← | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 4,568,721 | 0 | A | G | 100.0% | 136.2 / NA | 36 | I145T (ATC→ACC) | mcrB | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (21/15); total (21/15) |
TTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGATTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGATATACACCCGAAGTTGCCTGAAAATACTCTGCGATTGTT > NZ_CP009273/4568588‑4568855 | tttGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtg < 1:710840/139‑1 (MQ=255) tttGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtg < 2:259893/139‑1 (MQ=255) tctcTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtgtt < 1:234424/130‑1 (MQ=255) tctcTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtgtt > 2:234424/1‑130 (MQ=255) tctcTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCa > 2:789674/1‑138 (MQ=255) aTTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAgg > 2:323849/1‑139 (MQ=255) gTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATc > 1:823648/1‑139 (MQ=255) gTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATc > 1:851369/1‑139 (MQ=255) gTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATc > 2:293222/1‑139 (MQ=255) aGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGgt < 2:38545/138‑1 (MQ=255) aaaCAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATc > 2:185854/1‑138 (MQ=255) aaCAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCa < 1:323849/138‑1 (MQ=255) aTCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtg < 2:476685/100‑1 (MQ=255) aTCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtg > 1:476685/1‑100 (MQ=255) tAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCtgt > 2:712940/1‑136 (MQ=255) cAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGaa < 1:293222/139‑1 (MQ=255) cAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGa < 2:808064/138‑1 (MQ=255) tATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtg < 2:235109/75‑1 (MQ=255) tATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTAtg > 1:235109/1‑75 (MQ=255) tATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCg > 1:646339/1‑138 (MQ=255) tttttGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTg > 1:121892/1‑139 (MQ=255) tttttGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTg > 2:375946/1‑139 (MQ=255) aaTAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAgg > 1:359087/1‑110 (MQ=255) aaTAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAgg < 2:359087/110‑1 (MQ=255) cacTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGAtata > 1:658803/1‑138 (MQ=255) cacTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGAtata > 1:360529/1‑138 (MQ=255) ttGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTaa > 1:439536/1‑69 (MQ=255) ttGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTaa < 2:439536/69‑1 (MQ=255) gCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCGTAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAgg < 1:309494/98‑1 (MQ=255) gCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCGTAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAgg > 2:309494/1‑98 (MQ=255) aaTTAAATATTAATTTATAGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGATATACACCCGAAGTTGc > 1:857944/1‑139 (MQ=255) taGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCTTATTTTTTAGGATATACACCCGAAGTTGCCTGAAAATACTCTGCGa < 1:279092/139‑1 (MQ=255) taGTCGTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGATATACACCCGAAGTTGCCTGAAAATACTCTGCGa < 1:375946/139‑1 (MQ=255) gTTGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGATATACACCCGAAGTTGCCTGAAAATACTCTGCGATTGtt > 2:715834/1‑139 (MQ=255) ttGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGgtgt > 2:188574/1‑37 (MQ=255) ttGGTTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGgtgt < 1:188574/37‑1 (MQ=255) | TTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTCAGTTTTTGACATAGGTGGAATAACACTCTTGCCAGAATTAAATATTAATTTATAGTCGTTGATTATGTTGTCCAGCATAGAGGCAAATCGGGTGTAATCAATACCCTGTGAGACTTTTTGGGAACAGGCGTAATAGGACTGTCCGTATTTTTTAGGATATACACCCGAAGTTGCCTGAAAATACTCTGCGATTGTT > NZ_CP009273/4568588‑4568855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |