New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | = 355974 | 138 (3.000) | 4 (0.100) | 4/222 | 2.5 | 3.1% | coding (272/1155 nt) | cynX | cyanate transporter CynX |
? | NZ_CP009273 | = 355978 | 126 (3.010) | coding (276/1155 nt) | cynX | cyanate transporter CynX | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATGGGCGGCGGT > NZ_CP009273/355842‑356110 | ccATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTag > 1:71262‑M2/1‑137 (MQ=255) aTGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagca > 1:646610‑M2/1‑135 (MQ=255) aTGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagca > 1:409011‑M2/1‑135 (MQ=255) gggcgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagc < 1:143279‑M2/139‑7 (MQ=255) ggcgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg > 2:270497‑M2/1‑132 (MQ=255) ggcgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg > 2:685428‑M2/1‑132 (MQ=255) gcgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg < 1:34111‑M2/138‑8 (MQ=255) gcgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg < 1:843245‑M2/138‑8 (MQ=255) gcgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg < 2:432363‑M2/138‑8 (MQ=255) cgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgca > 1:556995‑M2/1‑130 (MQ=255) cgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgca > 2:566754‑M2/1‑130 (MQ=255) cgggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgca > 2:510292‑M2/1‑130 (MQ=255) ggcTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgcac < 1:430887‑M2/139‑11 (MQ=255) ctggcgctggcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGc > 2:796941/1‑139 (MQ=255) ctggcgctggcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGc > 1:562106/1‑139 (MQ=255) cgctggcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtgg > 2:551255/1‑139 (MQ=255) gctggcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggt < 2:143279/139‑1 (MQ=255) ctggcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtg < 1:291306/139‑1 (MQ=255) gtcGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtgg < 1:160455/135‑1 (MQ=255) gcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtgggg > 1:374369/1‑139 (MQ=255) gcCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtgggg > 1:630187/1‑139 (MQ=255) gCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgcactttgcgggtaaagctcacg > 2:377626‑M2/1‑110 (MQ=255) gCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGAt < 2:822345/139‑1 (MQ=255) gCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGAt < 1:575656/139‑1 (MQ=255) gCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGAt < 2:34111/139‑1 (MQ=255) gCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGAt < 2:862490/139‑1 (MQ=255) gCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGAt < 2:856614/139‑1 (MQ=255) gCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCgg < 2:377368/138‑1 (MQ=255) cATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAgg > 2:786744/1‑139 (MQ=255) tGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCg > 1:618309/1‑139 (MQ=255) cAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGt > 1:21594/1‑138 (MQ=255) cGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATg > 1:278716/1‑139 (MQ=255) aaCGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGcc > 2:316356/1‑139 (MQ=255) aaCGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGcc > 2:173040/1‑139 (MQ=255) gTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc < 1:796941/139‑1 (MQ=255) gTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc > 2:631282/1‑139 (MQ=255) tCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCg > 1:696574/1‑139 (MQ=255) tCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCg > 2:61113/1‑139 (MQ=255) tCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgcact < 1:477897‑M2/85‑12 (MQ=255) tCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgcact > 2:477897‑M2/1‑74 (MQ=255) tCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg < 1:100278‑M2/81‑8 (MQ=255) tCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcg > 2:100278‑M2/1‑74 (MQ=255) gCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgcactttgcgggtaaagctcacgcatcaatgcaccgacggcaatcagcaacagactgatgg > 2:801777‑M2/1‑72 (MQ=255) gCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCgg > 1:358952/1‑104 (MQ=255) gCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCgg < 2:358952/104‑1 (MQ=255) aGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtgg > 2:397743/1‑83 (MQ=255) tCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagcgca < 2:707395‑M2/73‑10 (MQ=255) 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ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTcag < 2:336053/138‑1 (MQ=255) atggCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGAATCATTCAGGCGGTGATGCCTCCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa < 2:146223/136‑1 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg > 2:46727/1‑122 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa > 1:420630/1‑139 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa < 2:417719/139‑1 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa > 2:323545/1‑139 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa < 2:604065/139‑1 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa > 1:589530/1‑139 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGATTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCCGCAGCGCa > 2:464208/1‑139 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACg < 2:535249/138‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCa < 1:538817/139‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCa < 2:231948/139‑1 (MQ=255) 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gCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTcc > 2:636960/1‑139 (MQ=255) gCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTcc < 1:516292/139‑1 (MQ=255) cTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCcg < 1:418339/139‑1 (MQ=255) tACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCgg > 2:529883/1‑139 (MQ=255) aCCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCgg < 1:649979/138‑1 (MQ=255) gTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATggg < 1:268350/139‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTcag < 1:881291/91‑1 (MQ=255) ctgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGc > 1:466706/1‑97 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACg > 1:749148/1‑95 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACg < 2:749148/95‑1 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATGGgcggcg > 2:387212/1‑138 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATGGgcggcg < 1:387212/138‑1 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCtg < 1:601256/112‑1 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCtg > 2:601256/1‑112 (MQ=255) ctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATGGGCGGCGGt < 1:851107/138‑1 (MQ=255) | CCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCC‑GCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATGGGCGGCGGT > NZ_CP009273/355842‑356110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |