| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 3370655 | 5 (0.100) | 71 (1.450) | 47/246 | 0.1 | 93.4% | coding (125/639 nt) | sspA | stringent starvation protein A |
| ? | NZ_CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | coding (391/417 nt) | BW25113_RS17825 | YrhA family protein | |||||
ATGCGGGAAACGCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/3370525‑3370655‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG > NZ_CP009273/3576788‑3576918 ATGCGGGAAACGCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGC < 2:680065/139‑1 GGGAAACGCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCC < 1:85265/139‑1 GGGAAACGCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGC > 2:104176/1‑138 CGCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:88656/139‑1 GCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:104176/139‑1 CTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCC > 2:783934/1‑131 CTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCC < 1:783934/131‑1 TCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:927231/139‑1 TCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:116376/139‑1 TCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:564356/139‑1 TCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:564425/139‑1 TCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:214806/139‑1 TCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:666623/1‑138 CATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:875797/1‑139 CATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:892373/1‑139 TGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 2:359989/1‑139 ATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:363441/1‑139 TGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGCTCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:472277/1‑139 TGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:176916/1‑139 TGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:775613/1‑139 TGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:552576/1‑139 TGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:521639/1‑139 CGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 2:632276/1‑138 ATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:892373/139‑1 TTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:771949/139‑1 AGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:649708/139‑1 GGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 2:592831/139‑1 TCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 2:458978/1‑139 AGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 1:239855/1‑139 AGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 2:429134/138‑1 AGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 2:875797/138‑1 CTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:837945/139‑1 CTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:775613/139‑1 GATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:618773/1‑138 CACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:458978/139‑1 ACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:807598/82‑1 ACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:807598/1‑82 CCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:406863/139‑1 GGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:359989/139‑1 TCGGAGCGATCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGACCTTGTGGTGATGCTGCCAACTTGCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCa < 2:932890/139‑2 TCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:703069/1‑139 TCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:674607/1‑139 TCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:517889/1‑139 GAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:553507/1‑139 AACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTG > 1:554478/1‑57 AACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTG < 2:554478/57‑1 CTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 1:418530/1‑103 CTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 2:418530/103‑1 TCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 2:38436/1‑137 TCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:839566/1‑66 TCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:839566/66‑1 ATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 1:521639/137‑1 GGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:138181/118‑1 GGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:138181/1‑118 GGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 2:386586/101‑1 GGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 1:386586/1‑101 AGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGT > 2:952346/1‑139 AGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 1:553507/138‑1 ATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG > 2:792307/1‑120 ATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG < 1:792307/120‑1 TCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:664291/1‑56 TCCTGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:664291/56‑1 TGAGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA > 1:289735/1‑138 AGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:104888/67‑1 AGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:104888/1‑67 AGGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACGTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAA > 1:830002/1‑137 GGCGGATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG < 1:38436/139‑1 GATTGTCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACC > 2:762455/1‑139 TCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG < 2:459667/138‑1 TCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG < 1:827690/130‑1 TCCTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG > 2:827690/1‑130 ATGCGGGAAACGCTCATCCAGATATTCCATAATGATGCGAGATTCCCACAGGGTCAGCTCACGATCCACCAGGGTCGGAACGCTCTGATTCGGGTTGAGGTCAATCAGATCCTGAGGCGGATTGTCCTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/3370525‑3370655‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG > NZ_CP009273/3576788‑3576918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |