Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,576,900 | (A)6→5 | intergenic (‑119/+283) | ydeN ← / ← ydeO | sulfatase/acid stress response transcriptional regulator YdeO |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,576,895 | 0 | A | . | 100.0% | 144.4 / NA | 33 | intergenic (‑114/+288) | ydeN/ydeO | sulfatase/acid stress response transcriptional regulator YdeO |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (14/19); total (14/19) |
TTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAA > NZ_CP009273/1576760‑1577026 | ttttCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGaaa > 2:828674/1‑138 (MQ=255) tAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACa < 1:1167957/139‑1 (MQ=255) ttCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACtt > 2:275544/1‑139 (MQ=255) ccTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACttt < 1:294081/138‑1 (MQ=255) ctctTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCt > 2:531443/1‑139 (MQ=255) ttcttATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTg < 1:789040/137‑1 (MQ=255) cttATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGtt < 1:506660/137‑1 (MQ=255) aTTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTa < 2:1212210/137‑1 (MQ=255) tGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTAtt > 2:834436/1‑137 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGaaaaaca < 2:795026/98‑3 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGaaaaaca > 1:795026/1‑96 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACAtt < 2:437989/118‑1 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACAtt > 1:437989/1‑118 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTaa > 1:944769/1‑139 (MQ=255) ttCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTtct < 2:1169083/139‑1 (MQ=255) cAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGc > 2:526130/1‑139 (MQ=255) tAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATa < 1:1150164/139‑1 (MQ=255) ttttACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAaac < 1:584752/139‑1 (MQ=255) tACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAaacaa < 1:794813/138‑1 (MQ=255) aaGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAAt > 1:873589/1‑139 (MQ=255) aGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGata < 1:834436/138‑1 (MQ=255) aTGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGat > 1:433408/1‑132 (MQ=255) aTGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGat < 2:433408/132‑1 (MQ=255) gTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAatta < 2:130090/139‑1 (MQ=255) aGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCAttt > 1:97596/1‑139 (MQ=255) gTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCAttt > 2:681094/1‑138 (MQ=255) aaGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACa < 2:676183/138‑1 (MQ=255) aGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATa > 1:803640/1‑84 (MQ=255) aGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATa < 2:803640/84‑1 (MQ=255) aGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATg > 1:212576/1‑136 (MQ=255) aGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATg > 1:76010/1‑136 (MQ=255) gATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAAtt < 2:1159685/139‑1 (MQ=255) gATTTAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAAtt < 2:705268/139‑1 (MQ=255) tAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACttt < 2:172402/47‑1 (MQ=255) tAGCTAAAAAAAGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACttt > 1:172402/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGG‑AAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCataaa < 2:353686/139‑1 (MQ=255) | TTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAA > NZ_CP009273/1576760‑1577026 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |