New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | 1390700 = | NA (NA) | 47 (0.740) | 32/240 | 0.6 | 50.5% | coding (332/981 nt) | BW25113_RS06980 | IS5‑like element IS5 family transposase |
? | NZ_CP009273 | 1422137 = | 46 (0.720) | coding (847/981 nt) | BW25113_RS07180 | IS5‑like element ISKpn26 family transposase |
TGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/1390834‑1390700 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > NZ_CP009273/1422137‑1422267 TGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGAT > 1:476981/1‑139 AGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGG < 1:537241/139‑1 GGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCT < 1:312830/139‑1 GGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCT < 1:662879/139‑1 GTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTC < 1:1208825/139‑1 TGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTC > 2:330703/1‑138 CTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACC < 1:75473/139‑1 GTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTC < 2:835793/125‑1 GTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTC > 1:835793/1‑125 GCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGC > 2:737919/1‑139 GCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGC > 1:685908/1‑139 ATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTG < 2:1099430/139‑1 ATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTG > 2:400504/1‑139 GACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCT < 1:330703/139‑1 ACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTT > 1:523024/1‑139 CCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATT > 2:833944/1‑139 CCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGC > 2:773137/1‑124 CCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGC < 1:773137/124‑1 CCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGG > 1:114478/1‑101 CCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGG < 2:114478/101‑1 TTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCA > 2:1054568/1‑115 TTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCA < 1:1054568/115‑1 GCCTGCGTCGGAAAGAAAGAGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGAACGGATGAGGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTT > 1:832981/1‑139 CTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTT > 2:418637/1‑139 GCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGT > 2:593316/1‑139 GCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGC > 2:914308/1‑89 GCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGC < 1:914308/89‑1 ATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCA < 2:419351/139‑1 ATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTC < 1:418637/138‑1 TTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTT > 1:1190498/1‑139 TTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGC < 2:1188384/120‑1 TTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGC > 1:1188384/1‑120 TTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTG > 1:1056565/1‑139 TTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTG > 1:674447/1‑139 TTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGT > 2:319775/1‑104 TTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGT < 1:319775/104‑1 TTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACAGGTGCTCCACCCGGGCACGGATGCTGCATTTCATGTATTCGATGTTGATGGCAGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTG > 2:635591/1‑139 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACG > 1:1156884/1‑139 AGTTGATGCTGCTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCT > 2:1166820/1‑139 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCGCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > 2:761148/1‑139 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > 2:566733/1‑139 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC < 2:674447/139‑1 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > 2:468666/1‑139 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > 2:417093/1‑139 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGA < 1:1699/124‑1 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGA > 2:1699/1‑124 CTCCAGCATGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGACGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > 2:1091210/1‑139 TGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/1390834‑1390700 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGC > NZ_CP009273/1422137‑1422267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |