Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,762,852 | 0 | T | C | 56.1% | 15.0 / 119.0 | 82 | T31A (ACG→GCG) | ydiJ | FAD‑binding and (Fe‑S)‑binding domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/19); new base C (22/24); total (39/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGTTCCTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATGTAGGTCGATACAC > NZ_CP009273/1762719‑1762985 | cGTTCCTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGc < 2:1093673/139‑1 (MQ=255) cGTTCCTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGc > 2:1251404/1‑139 (MQ=255) cTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGt > 1:597765/1‑138 (MQ=255) cTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGt < 2:36672/138‑1 (MQ=255) cTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGT‑AATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTa > 2:66917/1‑138 (MQ=255) cgGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAAcc > 2:29129/1‑139 (MQ=255) cAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCttg > 1:381348/1‑139 (MQ=255) aaGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCttgt < 2:480274/139‑1 (MQ=255) aaGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCttgt < 2:621900/139‑1 (MQ=255) gCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCttg < 2:477771/131‑1 (MQ=255) gCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCttg > 1:477771/1‑131 (MQ=255) gCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTc > 2:340472/1‑137 (MQ=255) gCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCAACGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTc > 2:689314/1‑137 (MQ=255) gATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCttgt > 1:1086189/1‑130 (MQ=255) gATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCttgt < 2:1086189/130‑1 (MQ=255) gcCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCa < 2:1072335/139‑1 (MQ=255) tCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAAt > 2:768009/1‑139 (MQ=255) cGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAg > 1:1273439/1‑139 (MQ=255) ggTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGc < 2:1146286/139‑1 (MQ=255) gTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCg < 2:1122671/96‑1 (MQ=255) gTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCg > 1:1122671/1‑96 (MQ=255) ttGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCAc < 2:34184/139‑1 (MQ=255) aaCGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCAc > 2:1161755/1‑136 (MQ=255) aaCGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCAc < 1:1161755/136‑1 (MQ=255) cgcgGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGtt > 1:1022713/1‑139 (MQ=255) ccGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCggg > 2:881613/1‑139 (MQ=255) ccGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCggg < 2:165966/139‑1 (MQ=255) gCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTg < 1:255816/139‑1 (MQ=255) cGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTg > 1:200663/1‑139 (MQ=255) ggAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGa < 2:117743/139‑1 (MQ=255) aaGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGCCGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATc > 1:769270/1‑139 (MQ=255) aaGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATc > 2:791956/1‑139 (MQ=255) ttGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCtgt < 2:1056980/139‑1 (MQ=255) ggTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGa > 1:549074/1‑110 (MQ=255) ggTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGa < 2:549074/110‑1 (MQ=255) gTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTgg < 2:1011588/138‑1 (MQ=255) gTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTgg < 1:477817/138‑1 (MQ=255) aaTACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATc < 2:1154346/139‑1 (MQ=255) aaTACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATc < 2:967726/139‑1 (MQ=255) aTACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCa < 1:487512/139‑1 (MQ=255) tACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCAt < 2:1022713/139‑1 (MQ=255) tACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCAt < 1:986468/139‑1 (MQ=255) cTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATta > 1:712601/1‑139 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat > 2:357688/1‑139 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat < 1:881613/139‑1 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat < 2:381348/139‑1 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCa > 1:199596/1‑91 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCa < 2:199596/91‑1 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACTAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat > 2:538918/1‑139 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat > 2:1111298/1‑139 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat > 1:1094459/1‑139 (MQ=255) ttgtCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTatat > 1:784387/1‑139 (MQ=255) gtcggtcgACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATAtt > 1:778210/1‑138 (MQ=255) ggtcgACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGAcc < 2:190517/139‑1 (MQ=255) ggtcgACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAac > 2:957042/1‑96 (MQ=255) ggtcgACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAac < 1:957042/96‑1 (MQ=255) aCATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTc > 2:1114169/1‑139 (MQ=255) aTTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCt < 1:66917/139‑1 (MQ=255) aTTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCt < 2:887137/139‑1 (MQ=255) ttGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTg < 1:791602/139‑1 (MQ=255) ttGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTg > 2:1151924/1‑139 (MQ=255) ttGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGACATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTg < 1:1111298/139‑1 (MQ=255) ttGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTg < 2:1273439/139‑1 (MQ=255) tCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGTCCCTTTCCTGCg < 1:1175058/138‑1 (MQ=255) tCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCg < 2:597765/138‑1 (MQ=255) gACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCt < 1:534156/139‑1 (MQ=255) gACGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCt < 2:29840/139‑1 (MQ=255) cGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCg < 2:1229129/133‑1 (MQ=255) cGATCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCg > 1:1229129/1‑133 (MQ=255) aTCGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTACAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTACGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGa > 2:433481/1‑139 (MQ=255) cGGCATAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATg > 2:852263/1‑139 (MQ=255) ggCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAAt > 2:16738/1‑96 (MQ=255) ggCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAAt < 1:16738/96‑1 (MQ=255) tAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGc < 1:814969/83‑1 (MQ=255) tAACTTGTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGc > 2:814969/1‑83 (MQ=255) aCTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGGTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATGTAGGTCg < 1:689314/139‑1 (MQ=255) gTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATGTAGGTCGATa > 2:635467/1‑138 (MQ=255) gTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCAc < 1:79417/56‑1 (MQ=255) gTCGCCGCATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCAc > 2:79417/1‑56 (MQ=255) cgccgcATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGt < 2:961133/118‑1 (MQ=255) cgccgcATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGt > 1:961133/1‑118 (MQ=255) cgccgcATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATGTAGGTCGATacac > 1:23602/1‑139 (MQ=255) cGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGt < 2:685127/118‑1 (MQ=255) cGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGt > 1:685127/1‑118 (MQ=255) cGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATGTAGGTCGATacac > 1:713266/1‑139 (MQ=255) tATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATg > 1:106035/1‑121 (MQ=255) tATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATg < 2:106035/121‑1 (MQ=255) | CGTTCCTGCGCGGCAAGACGGGCGATCAGCGCCACATCTGCGGTTGAACGCGGAAATACCACCGCATCGGGGAGAAGTTGGTAAATACTGTTGTCGGTCGACATTGTCAGACGATCGGCATAACTTGTCGCCGTATCGCCGGTAAAACCTTGTTGCTCCAGCTCTTGCAAAAAATTAAGCACCAGTTGAACGACGCCGGGTGCCTGGGAAATCTGTGGAATCATTATATTGACCCTTTCCTGCGGTCTGTGATGTAGGTCGATACAC > NZ_CP009273/1762719‑1762985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |