| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,942,149 | 0 | T | C | 51.2% | ‑6.6 / 132.9 | 82 | Y87C (TAC→TGC) | yebC | YebC/PmpR family DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (21/19); new base C (20/22); total (41/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.66e-03 | |||||||||||
| Rejected as consensus: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGAT > NZ_CP009273/1942021‑1942284 | cGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGt > 2:598403/1‑139 (MQ=255)cGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGt > 2:1164063/1‑139 (MQ=255) gAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGttt > 1:11069/1‑139 (MQ=255) gAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGttt > 1:289752/1‑139 (MQ=255) aaCCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTc > 1:600146/1‑139 (MQ=255) tCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGt > 2:162454/1‑139 (MQ=255) tACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGc < 2:464618/139‑1 (MQ=255) tACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTg > 1:588610/1‑138 (MQ=255) aCCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGca > 2:356762/1‑139 (MQ=255) aCCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGca > 1:79742/1‑139 (MQ=255) aGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACTGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatcat > 1:730816/1‑139 (MQ=255) gTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatcatca > 2:915779/1‑139 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCatcatcatc < 1:1102140/138‑1 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCAtcatcatca > 1:676141/1‑139 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCatcatcatc < 1:739482/138‑1 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCatcatcatc > 2:739482/1‑138 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCAtcatcatca > 1:132153/1‑139 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCAtcatcatca > 2:699048/1‑139 (MQ=255) aCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCAtcatcatca > 1:492673/1‑139 (MQ=255) ccGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCAtcatcatca < 2:676141/138‑1 (MQ=255) ccGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCAc < 2:1282647/139‑1 (MQ=255) ccGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCAc < 2:289752/139‑1 (MQ=255) cGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCAcc > 1:1108009/1‑139 (MQ=255) cacaTTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGcc < 2:11069/139‑1 (MQ=255) tttGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCcaca < 1:267532/139‑1 (MQ=255) tttGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCcaca < 1:1138590/139‑1 (MQ=255) gCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCAcacc < 1:598403/138‑1 (MQ=255) gCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCAcacc < 2:429718/138‑1 (MQ=255) tGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGc > 2:1123223/1‑138 (MQ=255) cATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCaa < 1:356762/138‑1 (MQ=255) aCGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTgcg < 1:392360/139‑1 (MQ=255) aCGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTgcg < 2:1206948/139‑1 (MQ=255) aCGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTgcg < 1:915779/139‑1 (MQ=255) aCGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTgcg < 1:969586/139‑1 (MQ=255) aCTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGt > 2:339198/1‑139 (MQ=255) aCTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGt > 2:867527/1‑139 (MQ=255) cTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGtt < 1:162454/139‑1 (MQ=255) cggtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAgtgtgt > 2:156841/1‑138 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCAc > 2:408051/1‑139 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCAc > 1:1040010/1‑139 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGatgatg > 2:616246/1‑75 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGatgatg < 1:616246/75‑1 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatca > 2:791240/1‑93 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatca < 1:791240/93‑1 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCAc > 1:765059/1‑139 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCAc > 1:232990/1‑139 (MQ=255) ttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:1040010/139‑1 (MQ=255) ttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:1109250/139‑1 (MQ=255) ttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:765059/139‑1 (MQ=255) ttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:1270224/139‑1 (MQ=255) ttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACCTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:1123223/139‑1 (MQ=255) cggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCAtgt > 1:177167/1‑139 (MQ=255) gttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTc < 1:451634/118‑1 (MQ=255) gttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTc > 2:451634/1‑118 (MQ=255) gttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCAtgttg < 2:79742/139‑1 (MQ=255) tCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTa < 2:1065510/138‑1 (MQ=255) agacagacATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 2:507194/138‑1 (MQ=255) agacagacATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 2:492673/138‑1 (MQ=255) agacagacAGTCAAGCATGATTGCCATGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCCGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCGCCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 1:543758/138‑1 (MQ=255) tgccgacaTTCAATCCTGATTGACGTGCCGCCCAGGA‑CGTAACCCTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACa < 2:132153/135‑1 (MQ=255) gacagacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACa < 2:697048/139‑1 (MQ=255) gacagacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACa < 2:670987/139‑1 (MQ=255) gacagacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACa < 2:1183429/139‑1 (MQ=255) gacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCAC‑GGTCATGTTGTTAGACAGTGCt > 1:835837/1‑139 (MQ=255) aTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCATGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCtt > 1:799370/1‑138 (MQ=255) aTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa > 2:439300/1‑130 (MQ=255) aTTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 1:439300/130‑1 (MQ=255) aTGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:827069/112‑1 (MQ=255) aTGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa > 2:827069/1‑112 (MQ=255) gATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCatcatcatc < 2:468086/63‑1 (MQ=255) gATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCatcatcatc > 1:468086/1‑63 (MQ=255) gccgtgccg‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcac > 2:774879/1‑139 (MQ=255) cgtgccg‑CCAGGACCGTAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcacg > 1:318226/1‑138 (MQ=255) ccg‑ccAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa > 1:522741/1‑100 (MQ=255) ccg‑ccAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:522741/100‑1 (MQ=255) ccg‑ccAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa > 2:180818/1‑100 (MQ=255) ccg‑ccAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:180818/100‑1 (MQ=255) tAACCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGt > 2:41512/1‑139 (MQ=255) aaCCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa > 1:512168/1‑87 (MQ=255) aaCCTTCGCAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:512168/87‑1 (MQ=255) aCCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTc < 1:867527/138‑1 (MQ=255) tCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGAt > 1:1145204/1‑139 (MQ=255) | CGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCG‑CCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGAT > NZ_CP009273/1942021‑1942284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |