Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,513,670 | G→A | V129V (GTG→GTA) | curA → | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,513,670 | 0 | G | A | 100.0% | 226.1 / NA | 60 | V129V (GTG→GTA) | curA | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (27/33); total (27/33) |
GAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAA > NZ_CP009273/1513538‑1513802 | gAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAgg > 1:354398/1‑138 (MQ=255) cAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCg > 2:830082/1‑139 (MQ=255) cAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCg > 1:878102/1‑139 (MQ=255) gTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCt > 1:1123181/1‑139 (MQ=255) gCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTtata < 1:695516/138‑1 (MQ=255) gCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTatat < 1:881169/139‑1 (MQ=255) gCGACTGGGTGATGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTtat < 2:539868/137‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGc < 1:600340/139‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGc < 1:499393/139‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTAc < 2:1123181/139‑1 (MQ=255) tGCTGGGGTACAGTGGATGGCCAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCCTCCGGCAAATCCATCCTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACt < 1:686662/139‑1 (MQ=255) tACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCg > 1:1269159/1‑139 (MQ=255) tACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCg > 1:1079348/1‑139 (MQ=255) cAGTGGATGGCAAGTCTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCTGt < 1:740066/139‑1 (MQ=255) cAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg < 1:333115/138‑1 (MQ=255) cAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg < 2:501871/138‑1 (MQ=255) tgttgATTGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTc < 2:702371/135‑1 (MQ=255) gATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg > 2:115442/1‑133 (MQ=255) gATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg > 2:674781/1‑133 (MQ=255) gATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg < 1:674781/133‑1 (MQ=255) gATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg < 1:115442/133‑1 (MQ=255) gATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGcc > 1:984387/1‑139 (MQ=255) gATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGcc > 1:893162/1‑139 (MQ=255) gACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCg < 1:1148587/100‑1 (MQ=255) gACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCg > 2:1148587/1‑100 (MQ=255) tGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGa < 2:1079348/138‑1 (MQ=255) cATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACg < 2:508644/139‑1 (MQ=255) atatCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAAGCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGTGCCTACTGCATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGt < 2:31979/139‑1 (MQ=255) atCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTa < 1:837526/86‑1 (MQ=255) atCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTa > 2:837526/1‑86 (MQ=255) atCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTtg > 1:179890/1‑139 (MQ=255) atCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTtg > 2:875307/1‑139 (MQ=255) ccAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTtggt > 2:1171877/1‑139 (MQ=255) tggtgATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTtggtgg > 2:983709/1‑137 (MQ=255) gtgATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGc > 2:963136/1‑139 (MQ=255) atgatCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGc > 1:243809/1‑89 (MQ=255) atgatCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGc < 2:243809/89‑1 (MQ=255) atgatCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGt < 1:742312/104‑1 (MQ=255) atgatCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGt > 2:742312/1‑104 (MQ=255) atgatCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTgc > 1:1270182/1‑139 (MQ=255) tgatCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTgcg < 1:816234/139‑1 (MQ=255) cTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGt < 2:147877/99‑1 (MQ=255) cTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGt > 1:147877/1‑99 (MQ=255) ggTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAg > 2:1290393/1‑53 (MQ=255) ggTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAg < 1:1290393/53‑1 (MQ=255) ggTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCa > 2:878094/1‑61 (MQ=255) ggTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCa < 1:878094/61‑1 (MQ=255) ggTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTc < 2:951546/98‑1 (MQ=255) ggTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTc > 1:951546/1‑98 (MQ=255) gTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg < 2:1291122/95‑1 (MQ=255) gTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGt > 1:1168887/1‑96 (MQ=255) gTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGt < 2:1168887/96‑1 (MQ=255) gTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGAc < 1:1240881/137‑1 (MQ=255) gTGAAACTTGGCGATCATCAGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCgg > 1:1291122/1‑95 (MQ=255) tGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTatat < 2:733051/76‑1 (MQ=255) tGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTatat > 1:733051/1‑76 (MQ=255) ggCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTg < 2:984387/138‑1 (MQ=255) tcatcCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCg < 1:239330/139‑1 (MQ=255) atcCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGa < 1:1183658/138‑1 (MQ=255) ggTGTACTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTaaa < 2:1269159/138‑1 (MQ=255) | GAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGGCAAGACTATGACATATCCAGTGGTGATGATCTGGTGAAACTTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAA > NZ_CP009273/1513538‑1513802 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |