| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,891,283 | A→G | D32G (GAT→GGT) | sdaA → | L‑serine ammonia‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,891,283 | 0 | A | G | 95.7% | 303.8 / 3.7 | 92 | D32G (GAT→GGT) | sdaA | L‑serine ammonia‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base G (49/39); total (51/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.48e-01 | |||||||||||
GTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGATCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAGGTAACGAACCTGC > NZ_CP009273/1891151‑1891415 | gTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGATCTGGt > 2:1192027/1‑139 (MQ=255) gTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGc > 1:1265804/1‑139 (MQ=255) aGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTAc > 2:1016540/1‑139 (MQ=255) gAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACt > 1:689344/1‑139 (MQ=255) ttatCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGc > 2:1149450/1‑116 (MQ=255) ttatCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGc < 1:1149450/116‑1 (MQ=255) ttatCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTcgcg < 2:689344/138‑1 (MQ=255) tatCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGtt > 1:308976/1‑139 (MQ=255) gTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCg > 1:1057102/1‑139 (MQ=255) tGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCATCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGt > 1:1226865/1‑139 (MQ=255) aTTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg > 2:606071/1‑138 (MQ=255) aTTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg > 2:673016/1‑138 (MQ=255) gTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGt < 2:985238/139‑1 (MQ=255) tCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGtt > 1:862164/1‑139 (MQ=255) tATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg < 1:505276/131‑1 (MQ=255) tATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg > 2:505276/1‑131 (MQ=255) ttCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCtt < 1:854124/101‑1 (MQ=255) ttCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCtt > 2:854124/1‑101 (MQ=255) ttCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTa < 1:539259/137‑1 (MQ=255) ttCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTa < 1:673016/137‑1 (MQ=255) tCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATgg > 1:107872/1‑139 (MQ=255) aTGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg > 2:1043349/1‑123 (MQ=255) aTGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg < 1:1043349/123‑1 (MQ=255) gTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCCTCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg > 2:747728/1‑121 (MQ=255) gTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTg < 1:747728/121‑1 (MQ=255) aaGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCg < 1:782922/138‑1 (MQ=255) aaGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGATCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCg < 1:1192027/138‑1 (MQ=255) ggTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTg < 2:98147/139‑1 (MQ=255) ggTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTg < 1:1149223/139‑1 (MQ=255) gggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACgg > 1:1009357/1‑139 (MQ=255) gggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACgg > 2:14263/1‑139 (MQ=255) ggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTcgcg < 2:1064249/102‑1 (MQ=255) ggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTcgcg > 1:1064249/1‑102 (MQ=255) ggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACggg > 2:670988/1‑139 (MQ=255) ggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACggg > 2:1189028/1‑139 (MQ=255) ggATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACggg > 1:293924/1‑139 (MQ=255) aTTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTa < 2:293924/139‑1 (MQ=255) gTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGa > 1:701961/1‑82 (MQ=255) gTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGa < 2:701961/82‑1 (MQ=255) gTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAgg > 1:539023/1‑139 (MQ=255) cTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGccac < 1:1016540/139‑1 (MQ=255) tCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGccac > 2:480915/1‑138 (MQ=255) cATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGa > 1:684558/1‑76 (MQ=255) cATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGa < 2:684558/76‑1 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTa > 2:476728/1‑65 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTa < 1:476728/65‑1 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCAc < 1:511417/108‑1 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCAc > 2:511417/1‑108 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACcaca < 2:481412/135‑1 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACcaca < 1:898708/135‑1 (MQ=255) cccATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACcaca < 1:606071/135‑1 (MQ=255) aTACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGatat < 2:107872/139‑1 (MQ=255) aTACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGatat < 1:644492/139‑1 (MQ=255) cGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGcc < 2:274976/139‑1 (MQ=255) gTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCtt > 1:287842/1‑56 (MQ=255) gTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCtt < 2:287842/56‑1 (MQ=255) tAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGcc > 1:449565/1‑80 (MQ=255) tAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGcc < 2:449565/80‑1 (MQ=255) tAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTa > 1:435565/1‑91 (MQ=255) tAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTa < 2:435565/91‑1 (MQ=255) tAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCat > 1:1100444/1‑139 (MQ=255) tAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGATCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCat > 2:991508/1‑139 (MQ=255) gggCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCatta > 2:1041333/1‑139 (MQ=255) gCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGttt < 2:802751/86‑1 (MQ=255) gCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGttt > 1:802751/1‑86 (MQ=255) cTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGATCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATtattat < 1:1042488/139‑1 (MQ=255) tATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATg > 2:299515/1‑139 (MQ=255) aTGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTg > 1:691318/1‑99 (MQ=255) aTGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTg < 2:691318/99‑1 (MQ=255) aTGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATgg > 2:868107/1‑139 (MQ=255) tGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATggg > 2:389763/1‑139 (MQ=255) gCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAg < 2:403440/37‑1 (MQ=255) gCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAg > 1:403440/1‑37 (MQ=255) gCAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTg > 1:531441/1‑139 (MQ=255) cAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATggg < 1:685054/133‑1 (MQ=255) cAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATggg > 2:685054/1‑133 (MQ=255) cAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGc < 1:480915/139‑1 (MQ=255) cAGGTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGc < 2:295733/139‑1 (MQ=255) ggTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGAc < 2:611541/92‑1 (MQ=255) ggTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGAc > 1:611541/1‑92 (MQ=255) ggTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAg > 2:366826/1‑139 (MQ=255) gTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCa < 2:1184180/120‑1 (MQ=255) gTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCa > 1:1184180/1‑120 (MQ=255) gTAAACAGTTCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAgg > 1:8188/1‑139 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCg > 1:498009/1‑78 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCg < 2:498009/78‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATtattat < 1:419833/119‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATtattat > 2:419833/1‑119 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAGGTAACGAAc > 2:829664/1‑139 (MQ=255) cgtcgATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAGGTAACGAACCt > 1:536621/1‑139 (MQ=255) gtcgATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAGGTAACGAACCTg < 1:1230491/139‑1 (MQ=255) cgATGGTCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAGGTAACGAACCTGc > 2:1031235/1‑138 (MQ=255) | GTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCTTCCCATACCGTAGGGCCTATGAAGGCAGGTAAACAGTTCGTCGATGATCTGGTCGAAAAAGGCTTACTGGATAGCGTTACTCGCGTTGCCGTGGACGTTTATGGTTCACTGTCGCTGACGGGTAAAGGCCACCACACCGATATCGCCATTATTATGGGTCTTGCAGGTAACGAACCTGC > NZ_CP009273/1891151‑1891415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |