| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,762,893 | T→C | intergenic (+48/‑169) | yfjQ → / → yfjR | DUF932 domain‑containing protein/WYL domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,762,893 | 0 | T | C | 91.5% | 209.2 / 11.3 | 71 | intergenic (+48/‑169) | yfjQ/yfjR | DUF932 domain‑containing protein/WYL domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/3); new base C (34/31); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
GTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGCCCCCCTCTTTAAAGTAAT > NZ_CP009273/2762760‑2763020 | gtgccgtgcGTGGCATTGACGGGTATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCt < 2:413535/138‑1 (MQ=255)gtgccgtgcGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGACCGCACCGCt < 2:434596/138‑1 (MQ=255) gccgtgcGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTAtg > 1:486343/1‑139 (MQ=255) tgcgtgGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCt > 2:710293/1‑139 (MQ=255) cgtgGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCg > 2:261024/1‑139 (MQ=255) tgGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCgtg < 1:834605/139‑1 (MQ=255) tgGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCgtg < 2:241139/139‑1 (MQ=255) tgGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCACACGCAACTTCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATAGCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCgtg < 2:283069/139‑1 (MQ=255) ttGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCt < 1:868917/139‑1 (MQ=255) tGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCt > 2:257805/1‑138 (MQ=255) cGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACGCCGCCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAAt < 2:1122629/139‑1 (MQ=255) cGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAAt < 2:856218/139‑1 (MQ=255) ggATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATccc < 2:224699/139‑1 (MQ=255) gATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATcccc > 1:210663/1‑139 (MQ=255) tgtgAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTAtgtg < 1:352675/118‑1 (MQ=255) tgtgAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTAtgtg > 2:352675/1‑118 (MQ=255) cTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAg > 1:279832/1‑139 (MQ=255) tAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCt > 1:962769/1‑139 (MQ=255) tAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCt > 1:916213/1‑139 (MQ=255) tAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCt > 2:647826/1‑139 (MQ=255) aaCCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCtt > 1:275118/1‑139 (MQ=255) aaCCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCtt > 1:736052/1‑139 (MQ=255) aCCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCttt > 1:1116764/1‑139 (MQ=255) gTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTaa > 1:1036581/1‑139 (MQ=255) gTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTaa > 2:1133241/1‑139 (MQ=255) tGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCtttt > 1:1259925/1‑136 (MQ=255) tGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCtttt < 2:1259925/136‑1 (MQ=255) tGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAAc > 2:902504/1‑139 (MQ=255) tGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAAc > 1:24634/1‑139 (MQ=255) cgcTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAAcc < 2:962769/138‑1 (MQ=255) cgcTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAAcc < 2:916213/138‑1 (MQ=255) cgcTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAAcc < 1:454821/138‑1 (MQ=255) ggCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTgg > 2:647865/1‑139 (MQ=255) tGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGa > 1:478963/1‑138 (MQ=255) gCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATccc < 2:828295/94‑1 (MQ=255) gCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATccc > 1:828295/1‑94 (MQ=255) gCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGaaa > 1:1189421/1‑139 (MQ=255) cTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGaaa > 1:1025860/1‑138 (MQ=255) cACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATa > 2:427619/1‑138 (MQ=255) gCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATaaaa > 2:126728/1‑138 (MQ=255) cAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATaaaaaa < 2:1036581/139‑1 (MQ=255) tGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAAt > 2:93343/1‑136 (MQ=255) tGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAAt < 1:93343/136‑1 (MQ=255) tAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTg > 1:281642/1‑139 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCg < 2:275118/139‑1 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGttt < 2:1135980/134‑1 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGttt > 1:1135980/1‑134 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCg < 2:1116764/139‑1 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCg < 2:10480/139‑1 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCg < 2:1022563/139‑1 (MQ=255) gACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCg < 1:710293/139‑1 (MQ=255) aCGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt < 1:556276/139‑1 (MQ=255) aCGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt < 2:259229/139‑1 (MQ=255) aCGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt < 2:1189421/139‑1 (MQ=255) aCGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt < 1:261024/139‑1 (MQ=255) aCGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt < 2:1095526/139‑1 (MQ=255) ttCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt < 2:163848/135‑1 (MQ=255) ttCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGt > 1:163848/1‑135 (MQ=255) ttCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTc > 2:248315/1‑139 (MQ=255) ttCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGCTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAATTAAAATATAGTTTCTGCGTTGTc > 2:314055/1‑139 (MQ=255) ttCATATTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGTACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGCAATAAAAAATAGTTTCTGCGTGGtt > 2:1058847/1‑138 (MQ=38) gCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATAccc < 2:1025860/138‑1 (MQ=255) ccACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTg > 2:695919/1‑139 (MQ=255) gttgttAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCg < 1:667243/139‑1 (MQ=255) gttgttAATATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCg < 1:647826/139‑1 (MQ=255) aaTATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGcccccc > 2:936688/1‑139 (MQ=255) aaTATCGGACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGccccc < 1:427619/138‑1 (MQ=255) gACACCACCTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGCCCCCCTCTTTa > 2:275785/1‑138 (MQ=255) ccTGTCCGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGCCCCCCTCTTTAAAGTAAt > 2:533714/1‑138 (MQ=255) cGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGcccc > 2:493401/1‑117 (MQ=255) cGCACCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGcccc < 1:493401/117‑1 (MQ=255) | GTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCTGCGTTGTCCATACCCTGTCCGCCCCCCTCTTTAAAGTAAT > NZ_CP009273/2762760‑2763020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |