| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,082,721 | T→C | V360A (GTC→GCC) | galP → | galactose/proton symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,082,721 | 0 | T | C | 97.6% | 289.0 / ‑1.6 | 82 | V360A (GTC→GCC) | galP | galactose/proton symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (46/34); total (47/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
ACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACG > NZ_CP009273/3082587‑3082854 | aCGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGt < 2:766311/139‑1 (MQ=255) cGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCCGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGtt < 2:320269/139‑1 (MQ=255) aacgctaacgctGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCAt > 2:206404/1‑138 (MQ=255) acgctaacgctGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCAt > 2:139981/1‑137 (MQ=255) ctaacgctGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTg < 1:510509/139‑1 (MQ=255) ctaacgctGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTg < 1:1104067/139‑1 (MQ=255) ggtcTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGTTCCCATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCg > 1:278655/4‑139 (MQ=255) ggCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCg < 1:817573/138‑1 (MQ=255) ggCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGc > 1:122460/1‑139 (MQ=255) ggCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGc > 1:1241938/1‑139 (MQ=255) ggCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGc > 2:337050/1‑139 (MQ=255) ggCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGc > 1:946619/1‑139 (MQ=255) aTGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa < 1:139981/138‑1 (MQ=255) aTGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa < 2:122460/138‑1 (MQ=255) aTGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTAc > 1:1201995/1‑139 (MQ=255) gctgctGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACtgt > 2:202807/1‑139 (MQ=255) tgGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGtttt < 2:1136465/100‑1 (MQ=255) tgGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGtttt > 1:1136465/1‑100 (MQ=255) ggCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAAtt < 2:993873/138‑1 (MQ=255) ggCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAAtt < 1:1085222/138‑1 (MQ=255) tACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGc < 1:236482/138‑1 (MQ=255) tACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGc > 2:236482/1‑138 (MQ=255) aCTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCg > 2:753426/1‑139 (MQ=255) aCTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATACTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCg > 1:723486/1‑139 (MQ=255) tACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGa > 2:74325/1‑137 (MQ=255) tACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGa > 1:824231/1‑137 (MQ=255) tACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGa > 1:1065287/1‑137 (MQ=255) tACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGa > 1:647227/1‑137 (MQ=255) tgatgCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCcg < 1:206404/139‑1 (MQ=255) tgCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCt < 1:164745/94‑1 (MQ=255) tgCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCt > 2:164745/1‑94 (MQ=255) tgCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGa > 1:464620/1‑139 (MQ=255) cATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt > 1:353031/1‑139 (MQ=255) cATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt > 2:121395/1‑139 (MQ=255) cATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt > 1:37406/1‑139 (MQ=255) cATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt > 1:1088117/1‑139 (MQ=255) cGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTgg > 2:668133/1‑138 (MQ=255) ggTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCa < 2:941724/139‑1 (MQ=255) gTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGc > 1:1173391/1‑76 (MQ=255) gTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGc < 2:1173391/76‑1 (MQ=255) gTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCAt > 1:935515/1‑139 (MQ=255) tATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATc < 2:935515/139‑1 (MQ=255) ttCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCAc > 2:930224/1‑139 (MQ=255) cACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCt > 2:1202026/1‑139 (MQ=255) aCTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTg > 2:844089/1‑139 (MQ=255) tctcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCAt > 1:980496/1‑62 (MQ=255) tctcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCAt < 2:980496/62‑1 (MQ=255) tctcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCt > 1:93193/1‑139 (MQ=255) tcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGAt > 1:22643/1‑78 (MQ=255) tcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGAt < 2:22643/78‑1 (MQ=255) ccGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCt < 1:1039430/74‑1 (MQ=255) ccGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCt > 2:1039430/1‑74 (MQ=255) ccGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGCTTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCa > 2:1217341/1‑139 (MQ=255) ccGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCa > 2:661775/1‑139 (MQ=255) cGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCa < 1:74325/138‑1 (MQ=255) cGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCa < 2:528445/138‑1 (MQ=255) tCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa > 2:901977/1‑81 (MQ=255) tCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa < 1:901977/81‑1 (MQ=255) ggCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGAt < 1:544745/72‑1 (MQ=255) ggCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGAt > 2:544745/1‑72 (MQ=255) ggCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGcc < 2:464620/139‑1 (MQ=255) cgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCAcc > 2:756884/1‑125 (MQ=255) cgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCAcc < 1:756884/125‑1 (MQ=255) cgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGccac > 1:57273/1‑139 (MQ=255) tATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACt < 1:68512/139‑1 (MQ=255) tcgccatcgccaTACTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGa < 2:723486/138‑1 (MQ=255) cgccatcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGAtt > 1:925788/1‑139 (MQ=255) gccatcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGAtt < 2:1201995/138‑1 (MQ=255) catcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGcc < 2:767423/139‑1 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCg > 1:20345/1‑50 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCg < 2:20345/50‑1 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa < 2:230661/62‑1 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa > 1:230661/1‑62 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCaa > 2:1285136/1‑139 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCaa > 2:934644/1‑139 (MQ=255) tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCaa > 2:42977/1‑139 (MQ=255) ctgATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa < 1:249976/51‑1 (MQ=255) ctgATGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTa > 2:249976/1‑51 (MQ=255) aTGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTgg < 1:661775/137‑1 (MQ=255) aTGTTTATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGgcg < 1:1285136/139‑1 (MQ=255) tttATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCa < 1:691368/138‑1 (MQ=255) tATTGCCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACg > 2:1147836/1‑139 (MQ=255) | ACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACG > NZ_CP009273/3082587‑3082854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |