| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,357,838 | T→C | V558A (GTC→GCC) | yhcD → | fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,357,838 | 0 | T | C | 92.9% | 255.1 / 10.0 | 84 | V558A (GTC→GCC) | yhcD | fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/2); new base C (53/25); total (57/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.34e-01 | |||||||||||
TAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCGGCAGTGATAG > NZ_CP009273/3357710‑3357973 | taataaAGCCGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATCCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGTCTCagatgag < 2:967249/139‑1 (MQ=255)taatGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgag < 1:735753/139‑1 (MQ=255)taatGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgag < 2:402072/139‑1 (MQ=255)taatGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACACCAGTATTCCATTTGGAAAAACAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgag < 2:36065/139‑1 (MQ=255)taatGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTAAACATCATTATTCCTTTTGGAAGACCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgag < 1:813532/139‑1 (MQ=255) aTCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGaa > 2:674624/1‑139 (MQ=255) aTCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGaa > 1:886409/1‑139 (MQ=255) ttCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCt > 1:228520/1‑138 (MQ=255) ttCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCt > 1:239323/1‑138 (MQ=255) ttCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCt > 2:1021605/1‑138 (MQ=255) ttCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCACAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCt > 2:1202331/1‑138 (MQ=255) cGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGaa < 1:1021605/136‑1 (MQ=255) gtaaaCACCAGTATCCCATTTGGCAGACCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACgag < 2:838714/136‑1 (MQ=255) aCATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCa > 1:616330/1‑139 (MQ=255) aCATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCa > 1:838714/1‑139 (MQ=255) aCATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCa > 1:929837/1‑139 (MQ=255) aCATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAAAACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGTTCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCa > 2:1029161/1‑139 (MQ=255) tCATTATTCCTTTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCacga < 1:27887/139‑1 (MQ=255) cATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTg > 1:864381/1‑138 (MQ=255) ggCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAAc > 1:373170/1‑137 (MQ=255) aTCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgagatg > 2:456821/1‑88 (MQ=255) aTCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgagatg < 1:456821/88‑1 (MQ=255) cAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGaa > 1:789232/1‑139 (MQ=255) gCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTa > 1:683299/1‑139 (MQ=255) cacTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAg < 2:518435/139‑1 (MQ=255) cTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgag > 2:1047765/1‑69 (MQ=255) cTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCagatgag < 1:1047765/69‑1 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 1:931833/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCctacta < 2:86917/77‑1 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCctacta > 1:86917/1‑77 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCa < 1:830945/127‑1 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCa > 2:830945/1‑127 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 2:1034649/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 1:1022970/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 1:1288646/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 1:80697/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 1:414175/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTcc > 1:297055/1‑138 (MQ=255) tataCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTc < 1:1165034/137‑1 (MQ=255) taCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAAt < 2:789232/139‑1 (MQ=255) taCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAAt < 2:1116862/139‑1 (MQ=255) taCTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAAt < 1:674624/139‑1 (MQ=255) tCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAAtctc > 1:1250848/1‑139 (MQ=255) cGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGc < 2:533531/120‑1 (MQ=255) cGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGc > 1:533531/1‑120 (MQ=255) gCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCa > 2:396188/1‑139 (MQ=255) ccATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAt > 1:580824/1‑139 (MQ=255) ccATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAt > 1:296683/1‑139 (MQ=255) ccATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAt > 1:470312/1‑139 (MQ=255) ccATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAt > 1:382754/1‑139 (MQ=255) ccATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAt > 2:168877/1‑139 (MQ=255) ccATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAt > 2:268294/1‑139 (MQ=255) cATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAtt < 2:470312/139‑1 (MQ=255) aTGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTa > 1:905824/1‑139 (MQ=255) gACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTaca > 2:755709/1‑139 (MQ=255) gACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTaca > 1:341051/1‑139 (MQ=255) aCGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTaca < 2:80697/138‑1 (MQ=255) cACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTg < 2:341051/139‑1 (MQ=255) aCTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATTTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGc > 2:543237/1‑139 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCt < 1:274525/135‑1 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCt < 2:895232/135‑1 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCt > 1:895232/1‑135 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCt > 2:274525/1‑135 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGcc > 2:354721/1‑139 (MQ=255) gtgtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGACTGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCCTTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAg > 2:229242/1‑139 (MQ=255) gtgtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCa < 2:1288646/137‑1 (MQ=255) gtgtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAg > 2:493126/1‑139 (MQ=255) gtgtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAg > 1:375241/1‑139 (MQ=255) gtgtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAg > 1:1088715/1‑139 (MQ=255) gtgtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAg > 2:1148301/1‑139 (MQ=255) gagccATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTGGCACGGCCGTATCAGTTCCAGTCCCGATTACACGCAAGTCAGCCTTGCTGCAGGAGCAAg > 2:1132412/5‑139 (MQ=255) gtCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAtt < 1:1282980/106‑1 (MQ=255) gtCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCAtt > 2:1282980/1‑106 (MQ=255) gtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCg > 2:1213838/1‑139 (MQ=255) gtCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCg > 2:811285/1‑139 (MQ=255) tCATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCgg > 1:1132533/1‑139 (MQ=255) cATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACg > 1:568534/1‑80 (MQ=255) cATGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACg < 2:568534/80‑1 (MQ=255) aTGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCa > 1:1090009/1‑94 (MQ=255) aTGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCa < 2:1090009/94‑1 (MQ=255) aTGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCgg > 1:954619/1‑137 (MQ=255) aTGGGAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCgg > 2:1029658/1‑137 (MQ=255) ggAGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCGGCAGt > 1:1287247/1‑138 (MQ=255) aGTCGCCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCGGCAGTGa > 1:853763/1‑138 (MQ=255) tcgccTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCGGCAGTGATAg > 2:658493/1‑139 (MQ=255) tcgccTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCGGCAGTGATAg > 2:815348/1‑139 (MQ=255) | TAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGATCAAACACCGCCACACTGTATACTCGCCATGACGATCATAAAACCCACTATGGTACTGGTGTCATGGGAGTCGTCTCAGATGAGATGTCCTACTATGTGAATGCTGAACGAGATCACGACGAACGTGAAACGAGCTTGAACGGCAGTATCAGTTCCAATCTCCATTACACCCAAGTCAGCCTTGCCGCAGGAGCAAGCGGCAGTGATAG > NZ_CP009273/3357710‑3357973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |