Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,413,569 | T→C | I26T (ATC→ACC) | yhdX → | amino acid ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,413,569 | 0 | T | C | 97.3% | 243.9 / ‑1.6 | 73 | I26T (ATC→ACC) | yhdX | amino acid ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (32/39); total (33/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.04e-02 |
CGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTC > NZ_CP009273/3413441‑3413696 | cGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCgtt > 1:467207/1‑139 (MQ=255) cGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCgtt > 2:1118478/1‑139 (MQ=255) cGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGTCCCTTGCCGttgttg > 1:999056/1‑139 (MQ=255) cGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGttgttg > 1:1134653/1‑139 (MQ=255) tCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCt < 1:769245/126‑1 (MQ=255) tCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCt > 2:769245/1‑126 (MQ=255) tCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCt > 2:364988/1‑139 (MQ=255) ggcggcGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCg > 2:1134450/1‑139 (MQ=255) gcgcTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCAt > 2:293409/1‑139 (MQ=255) cAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTgttggtt < 1:721238/137‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 1:350236/139‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 1:733770/139‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 1:556571/139‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 2:514113/139‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 1:364988/139‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 1:113570/139‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 1:1134450/139‑1 (MQ=255) cGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCTTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa < 1:1124414/139‑1 (MQ=255) cGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt > 1:392581/1‑137 (MQ=255) cGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTtggttggt < 2:392581/137‑1 (MQ=255) cGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa < 2:201461/139‑1 (MQ=255) cGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa > 2:1124414/1‑139 (MQ=255) cGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa < 1:1118478/139‑1 (MQ=255) tGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTca < 1:263023/139‑1 (MQ=255) tGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTca < 1:442426/139‑1 (MQ=255) tGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTca > 2:442426/1‑139 (MQ=255) tCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa > 2:758163/1‑129 (MQ=255) tCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa < 1:758163/129‑1 (MQ=255) tCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCacaaca > 1:788795/1‑139 (MQ=255) tttCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAAc > 2:973871/1‑139 (MQ=255) tCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTaa < 1:682394/136‑1 (MQ=255) tCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTaa > 2:682394/1‑136 (MQ=255) tCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACg > 2:312708/1‑138 (MQ=255) tcATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCaa > 1:605378/1‑138 (MQ=255) tcATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCaa > 1:466939/1‑138 (MQ=255) aTCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTgttgg < 1:747935/103‑1 (MQ=255) aTCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTgttgg > 2:747935/1‑103 (MQ=255) aTCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTca < 2:1207776/115‑1 (MQ=255) aTCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTca > 1:1207776/1‑115 (MQ=255) aTCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCaataa > 1:44007/1‑139 (MQ=255) aTCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCaa < 1:288382/136‑1 (MQ=255) gccgcTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCg < 2:1134653/139‑1 (MQ=255) cgcTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTcac > 1:773119/1‑111 (MQ=255) cgcTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTcac < 2:773119/111‑1 (MQ=255) cTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa > 1:1097934/1‑103 (MQ=255) cTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa < 2:1097934/103‑1 (MQ=255) cTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTgg > 1:1252562/1‑138 (MQ=255) cTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGc < 1:126168/139‑1 (MQ=255) aaCCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCa < 2:283409/137‑1 (MQ=255) ccGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTAc > 1:1230260/1‑139 (MQ=255) gTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACtt < 2:788795/139‑1 (MQ=255) aCTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCt > 2:828873/1‑48 (MQ=255) aCTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCt < 1:828873/48‑1 (MQ=255) aCTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTg < 2:1230260/137‑1 (MQ=255) ctctTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCtgtt < 1:1006336/61‑1 (MQ=255) ctctTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCtgtt > 2:1006336/1‑61 (MQ=255) ttttGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCttt < 1:312708/136‑1 (MQ=255) aCCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCgcgg > 1:430723/1‑139 (MQ=255) cGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCt < 2:605378/137‑1 (MQ=255) ttCGCGCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCtt < 2:1145550/139‑1 (MQ=255) cgcgCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa > 2:682581/1‑60 (MQ=255) cgcgCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTa < 1:682581/60‑1 (MQ=255) cgcgCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCt < 1:785994/132‑1 (MQ=255) cgcgCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCt > 2:785994/1‑132 (MQ=255) cgcgCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCg > 1:813336/1‑139 (MQ=255) cgcgCCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCg > 2:329503/1‑139 (MQ=255) gcgcCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCgg > 2:627009/1‑139 (MQ=255) gcgcCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCg < 2:345856/138‑1 (MQ=255) gcCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTa < 2:559994/139‑1 (MQ=255) gcCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTa < 2:467207/139‑1 (MQ=255) gcCTGGTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTa < 1:293409/139‑1 (MQ=255) gTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTc < 1:973871/139‑1 (MQ=255) gTTATTCCAGACCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTc < 2:430723/139‑1 (MQ=255) | CGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTC > NZ_CP009273/3413441‑3413696 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |