Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,429,447 | T→G | G294G (GGT→GGG) | rsmB → | 16S rRNA (cytosine(967)‑C(5))‑methyltransferase RsmB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,429,447 | 0 | T | G | 100.0% | 248.6 / NA | 63 | G294G (GGT→GGG) | rsmB | 16S rRNA (cytosine(967)‑C(5))‑methyltransferase RsmB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (31/32); total (31/32) |
TTTGTGCCGCCCCCGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGTATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAGATATTAAATG > NZ_CP009273/3429323‑3429581 | tttGTGCCGCCCCCGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGt > 1:1254018/1‑139 (MQ=255) tgtgCCGCCCCCGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGAcc < 2:310786/135‑1 (MQ=255) cccccGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAgg > 2:100949/1‑139 (MQ=255) ccGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGa < 2:708236/139‑1 (MQ=255) cggcggTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGAt < 1:1035941/139‑1 (MQ=255) ggcggTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACATGGTGATg > 1:548807/1‑139 (MQ=255) aaaCAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTa < 1:21571/139‑1 (MQ=255) aaaCAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTa < 1:1006353/139‑1 (MQ=255) acaacGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTAcc < 1:218586/139‑1 (MQ=255) acaacGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTAcc < 1:537303/139‑1 (MQ=255) atatCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCa < 1:81203/139‑1 (MQ=255) tCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATg < 1:1185142/139‑1 (MQ=255) tGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGgtgt > 1:866991/1‑139 (MQ=255) tGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGgtgt > 1:750196/1‑139 (MQ=255) gCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGtgtg > 1:1170960/1‑133 (MQ=255) gCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGtgtg < 2:1170960/133‑1 (MQ=255) gCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAg > 1:262317/1‑138 (MQ=255) gCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAg > 2:355600/1‑138 (MQ=255) gCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAg > 2:1173763/1‑138 (MQ=255) gCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAg > 1:459872/1‑138 (MQ=255) cACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGc > 1:449572/1‑138 (MQ=255) cgcAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGc > 1:1247304/1‑129 (MQ=255) cgcAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGc < 2:1247304/129‑1 (MQ=255) cgcAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGa > 1:150129/1‑139 (MQ=255) gcAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGAt < 2:750196/139‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGAt > 1:201049/1‑96 (MQ=255) cAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGAt < 2:201049/96‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATc > 1:493425/1‑139 (MQ=255) cAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATc > 1:186859/1‑139 (MQ=255) gttgttGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCa < 1:100949/139‑1 (MQ=255) gttgttGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCa > 1:355469/1‑139 (MQ=255) tgCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTtta > 2:449296/1‑139 (MQ=255) tCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGcc < 1:1019412/139‑1 (MQ=255) acgaACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGgtg > 1:867918/1‑97 (MQ=255) acgaACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGgtg < 2:867918/97‑1 (MQ=255) gcCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAAc < 1:1056283/139‑1 (MQ=255) gcCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGAGCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAAc < 1:1112309/139‑1 (MQ=255) gggTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGAt < 2:75234/139‑1 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACTGTGAAAc > 2:850404/1‑43 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAAc < 1:850404/43‑1 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGAt < 2:264123/51‑1 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGAt > 1:264123/1‑51 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCt < 1:635617/63‑1 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCt > 2:635617/1‑63 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCaa > 2:1088444/1‑124 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCaa < 1:1088444/124‑1 (MQ=255) tACGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATtcgt < 2:1214224/138‑1 (MQ=255) aCGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTAcc < 1:580359/60‑1 (MQ=255) aCGACAATTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTAcc > 2:580359/1‑60 (MQ=255) aaTTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATc < 1:523975/139‑1 (MQ=255) aTTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGAt > 1:902961/1‑101 (MQ=255) aTTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGAt < 2:902961/101‑1 (MQ=255) aTTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAAc < 2:248459/118‑1 (MQ=255) aTTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAAc > 1:248459/1‑118 (MQ=255) aTTTAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATc > 2:665654/1‑138 (MQ=255) tttAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATc > 1:801104/1‑137 (MQ=255) tttAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCa < 1:603222/139‑1 (MQ=255) tAAAACGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAg < 1:56240/138‑1 (MQ=255) cGCCTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAGATATTa < 1:1173763/139‑1 (MQ=255) cTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGc > 2:20409/1‑123 (MQ=255) cTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGc < 1:20409/123‑1 (MQ=255) cTTGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAGATATTAAAt > 1:159523/1‑139 (MQ=255) ttGGGATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAGATATTAAATg > 1:413033/1‑139 (MQ=255) | TTTGTGCCGCCCCCGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGTATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAGATATTAAATG > NZ_CP009273/3429323‑3429581 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |