| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,913,243 | A→C | V174G (GTC→GGC) | atpH ← | F0F1 ATP synthase subunit delta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,913,243 | 0 | A | C | 97.5% | 288.9 / ‑1.0 | 80 | V174G (GTC→GGC) | atpH | F0F1 ATP synthase subunit delta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (40/38); total (41/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
TCACTTACAGAAACAATAGTACCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGACGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGACGTTTTTC > NZ_CP009273/3913111‑3913376 | tCACTTACAGAAACAATAGTACCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTg > 1:334482/1‑139 (MQ=255) aCAGAAACAATAGTACCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAg < 1:105010/137‑1 (MQ=255) cAGAAACAATAGTACCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGgcg < 1:1192709/139‑1 (MQ=255) aaaCAATAGTACCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCt > 2:149089/1‑138 (MQ=255) accaacGTTGTGAGCTACACCCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTATGATGATAAAGGAGGAATGAAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCAGTAGGAAAGGCGCTCAAGACGACcg > 1:1005364/6‑139 (MQ=255) aCCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACcg > 1:283711/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTa > 1:516464/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTa > 1:518124/1‑139 (MQ=255) gTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCa < 1:78337/115‑1 (MQ=255) gTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCa > 2:78337/1‑115 (MQ=255) gTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACg > 2:319636/1‑139 (MQ=255) gTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACg < 1:149089/139‑1 (MQ=255) tgAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGc < 2:66770/139‑1 (MQ=255) gAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGt < 2:531674/131‑1 (MQ=255) gAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGt > 1:531674/1‑131 (MQ=255) aGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGcc < 2:516464/138‑1 (MQ=255) cTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATc < 1:576185/139‑1 (MQ=255) actcacAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGTCTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATg < 1:319636/139‑1 (MQ=255) actcacAACATTGAACTGAGCAATGCGCTACTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGCCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAAt < 2:331633/138‑1 (MQ=255) caacaTTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCat < 1:925988/139‑1 (MQ=255) ttGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGGTGCAGGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCaa < 2:356472/139‑2 (MQ=255) cTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCt < 1:1030361/139‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAGTGACCATATCACCCGCTCg < 1:881992/138‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCg > 2:441712/1‑138 (MQ=255) aGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCg > 2:536230/1‑138 (MQ=255) aGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCg > 1:1261154/1‑138 (MQ=255) aGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCg > 2:545055/1‑138 (MQ=255) aGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCg > 1:937053/1‑138 (MQ=255) aTGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGgatga < 2:915770/139‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATg > 2:780667/1‑116 (MQ=255) tGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATg < 1:780667/116‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGgatgat < 2:937053/139‑1 (MQ=255) tgctTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAg > 2:189436/1‑77 (MQ=255) tgctTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAg < 1:189436/77‑1 (MQ=255) tgctTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGc > 2:68031/1‑139 (MQ=255) ctTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGc > 1:1268339/1‑101 (MQ=255) ctTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGc < 2:1268339/101‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 1:762077/137‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 1:68031/137‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 1:684969/137‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 2:518124/137‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 1:545055/137‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 1:1077984/137‑1 (MQ=255) tCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCAt > 1:1241709/1‑139 (MQ=255) cGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGc < 1:1211630/87‑1 (MQ=255) cGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGc > 2:1211630/1‑87 (MQ=255) aTTGCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACAACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACtt < 2:994054/137‑1 (MQ=255) tCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGa > 1:60355/1‑139 (MQ=255) ttCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAAt < 2:60355/139‑1 (MQ=255) cAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAAtt < 1:536230/138‑1 (MQ=255) ttGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGcc < 2:1138587/105‑1 (MQ=255) ttGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGcc > 1:1138587/1‑105 (MQ=255) ttGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGc > 1:1095641/1‑139 (MQ=255) ttGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGc > 1:631977/1‑139 (MQ=255) cATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGgcg > 1:341844/1‑42 (MQ=255) cATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGgcg < 2:341844/42‑1 (MQ=255) tCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAAt > 2:672685/1‑67 (MQ=255) tCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAAt < 1:672685/67‑1 (MQ=255) cAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCt > 2:103654/1‑81 (MQ=255) cAGTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCt < 1:103654/81‑1 (MQ=255) gTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCa < 1:253774/61‑1 (MQ=255) gTCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCa > 2:253774/1‑61 (MQ=255) tCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGcc < 2:1281556/92‑1 (MQ=255) tCCCCTTAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGcc > 1:1281556/1‑92 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGcc > 2:432261/1‑51 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGcc < 1:432261/51‑1 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATa > 1:149552/1‑82 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATa < 2:149552/82‑1 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTa > 2:623787/1‑95 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTa < 1:623787/95‑1 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGa > 2:1180540/1‑139 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGa > 1:610302/1‑139 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGCCGCCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCCGCCATCAATGACCATATCACCAGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGa > 2:1071435/1‑139 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGACGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg < 2:1126950/89‑1 (MQ=255) ttAAGACTGCAAGACGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTg > 1:1126950/1‑89 (MQ=255) aCTGCAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGACGttt > 2:96462/1‑139 (MQ=255) tGCAAGCCGTCTGCAAGGCTCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGAAGttttc > 1:495115/1‑138 (MQ=255) cAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGACGTTTTTc > 2:610405/1‑138 (MQ=255) cAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGACGTTTTTc > 1:593335/1‑138 (MQ=255) cAAGCCGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGACGTTTTTc > 2:369328/1‑138 (MQ=255) | TCACTTACAGAAACAATAGTACCTTCGTTGTGAGCTTCACTCACAACATTGAACTGAGCAATGCGCTGCTTGATCAGTTCGCTGATTTCGGTGGAATTCAGTTGCATGCTCCAGTCCCCTTAAGACTGCAAGACGTCTGCAAGGCGCTCAAGACGACCGCGTACGCTGCCATCAATGACCATATCACCCGCTCGGATGATAACGCCTGCCATTACAGACTTATCGATTTTGCAATTCAGCTTAACTTTGCGTGACAGACGTTTTTC > NZ_CP009273/3913111‑3913376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |