| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 4,001,645 | C→T | R177C (CGC→TGC) | rhtC → | threonine export protein RhtC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 4,001,645 | 0 | C | T | 94.2% | 236.8 / 3.2 | 69 | R177C (CGC→TGC) | rhtC | threonine export protein RhtC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base T (38/27); total (41/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.25e-01 | |||||||||||
TGGCTCGGTGTTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGCGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGATAAGGCGTTTACG > NZ_CP009273/4001512‑4001779 | tGGCTCGGTGTTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCg < 2:14821/138‑1 (MQ=255)tGGCTCGGTGTTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGCGcc < 1:1243998/137‑1 (MQ=255) cTCGGTGTTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGt > 1:608754/1‑139 (MQ=255) gtgtTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTAt > 1:1229986/1‑138 (MQ=255) gtgtTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTAt > 2:1208006/1‑138 (MQ=255) gtgtTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTAt > 2:173231/1‑138 (MQ=255) gtttgtCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGc > 2:1166732/1‑138 (MQ=255) tttgtCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCg < 1:376592/138‑1 (MQ=255) tCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTg > 2:1268341/1‑139 (MQ=255) ggTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGACGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGa > 1:1207081/1‑139 (MQ=255) aTAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTg < 2:935526/138‑1 (MQ=255) aTAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGa > 2:942157/1‑139 (MQ=255) gTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGtt < 1:1208006/139‑1 (MQ=255) ggCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTg > 1:1221306/1‑139 (MQ=255) aCCGCGCGCTGTGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTg < 2:49011/124‑1 (MQ=255) aCCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCg < 1:1286927/95‑1 (MQ=255) aCCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCg > 2:1286927/1‑95 (MQ=255) aCCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTg > 1:49011/1‑124 (MQ=255) ccGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCgggg < 1:1047442/138‑1 (MQ=255) ccGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCggg < 1:942157/137‑1 (MQ=255) ccGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGc > 1:1275664/1‑139 (MQ=255) ccGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGACGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCgggg < 2:1207081/138‑1 (MQ=255) cgcgcTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGt > 1:348437/1‑138 (MQ=255) cgcgcTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGt > 2:498439/1‑138 (MQ=255) cgcgcTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGt > 1:752363/1‑138 (MQ=255) cgcTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTAt > 2:566290/1‑139 (MQ=255) tGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTg > 2:754786/1‑139 (MQ=255) gggCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGcc > 2:1072750/1‑139 (MQ=255) gggCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGCGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGcc > 2:489471/1‑139 (MQ=255) cgcTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGcat > 1:1058228/1‑139 (MQ=255) cgcTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGca < 1:175104/138‑1 (MQ=255) aTCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGcattcatt > 2:21591/1‑139 (MQ=255) tGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGat > 1:702060/1‑138 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCg > 1:1260954/1‑77 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCg < 2:1260954/77‑1 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTc > 1:377529/1‑139 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTc > 2:599470/1‑139 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTc > 2:616984/1‑139 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTc > 2:727486/1‑139 (MQ=255) aaaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTc > 1:1277900/1‑139 (MQ=255) aaCGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTcg < 2:1236340/139‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCGTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTcgcg < 1:754786/139‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTcgcg < 2:702060/139‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt < 2:608754/139‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt > 2:429277/1‑139 (MQ=255) aCCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGAcg < 1:566290/138‑1 (MQ=255) ccGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGAcgc < 1:595500/138‑1 (MQ=255) cgtTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGACGCCAGACGCGTCtt > 2:816010/1‑139 (MQ=255) gtTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt > 1:401914/1‑121 (MQ=255) gtTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt < 2:401914/121‑1 (MQ=255) gtTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCtt < 1:616984/138‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt > 2:968002/1‑120 (MQ=255) ttGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt < 1:968002/120‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCtt > 1:37241/1‑137 (MQ=255) ttGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCtt > 2:381121/1‑137 (MQ=255) ttGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCtt > 2:1237350/1‑137 (MQ=255) cAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGt < 2:392814/139‑1 (MQ=255) cAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGt < 2:1058228/139‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGt < 2:406716/139‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGt < 2:620909/139‑1 (MQ=255) tttGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt > 1:213048/1‑109 (MQ=255) tttGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGt < 2:213048/109‑1 (MQ=255) tGCCCTGCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGa > 1:37301/1‑138 (MQ=255) tGCCCTGCCGCAAATGCGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGa > 2:337112/1‑138 (MQ=255) gCCGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTTATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGATAAGGCg > 1:190982/1‑139 (MQ=255) ccGCAAATGCGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGATAAGGCGt > 2:1192646/1‑139 (MQ=255) cGCAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGATAAGGCGtt > 2:585946/1‑139 (MQ=255) cAAATGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGATAAGGCGTTTa < 1:1193443/139‑1 (MQ=255) aaTGTGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGTATAAGGCGTTTAcg < 2:1085930/139‑1 (MQ=255) | TGGCTCGGTGTTCTCATTGTTTGTCGGTGATAACGTTGGCACTACCGCGCGCTGGGGCATTTTTGCGCTGATCATTGTCGAAACGCTGGCGTGGTTTACCGTCGTTGCCAGCCTGTTTGCCCTGCCGCAAATGCGCCGTGGTTATCAACGTCTGGCGAAGTGGATTGATGGTTTTGCCGGGGCGTTATTTGCCGGATTTGGCATTCATTTGATTATTTCGCGGTGATGCCAGACGCGTCTTCAGAGTAAGTCGGATAAGGCGTTTACG > NZ_CP009273/4001512‑4001779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |