| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 4,525,950 | T→A | intergenic (+102/+166) | yjhR → / ← BW25113_RS26295 | helicase YjhR/HNH endonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 4,525,950 | 0 | T | A | 95.8% | 351.1 / 5.3 | 96 | intergenic (+102/+166) | yjhR/BW25113_RS26295 | helicase YjhR/HNH endonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base A (43/49); total (45/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-01 | |||||||||||
CAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCAT > NZ_CP009273/4525814‑4526084 | cAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACt < 1:903756/139‑1 (MQ=255)cAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACt < 1:98220/139‑1 (MQ=255) tGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGt < 2:876453/138‑1 (MQ=255) gTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTAcc < 2:1067002/138‑1 (MQ=255) gTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCt < 1:1062123/139‑1 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTAcc > 1:1191748/1‑137 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTAcc < 2:1191748/137‑1 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCt > 1:1167909/1‑138 (MQ=255) tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAAt > 1:414909/1‑139 (MQ=255) gATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCa > 1:543453/1‑139 (MQ=255) aTCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAt > 2:81654/1‑139 (MQ=255) tCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAtt < 2:474888/139‑1 (MQ=255) tCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAtt < 2:243061/139‑1 (MQ=255) tCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAtt < 2:1167909/139‑1 (MQ=255) cAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAttt > 1:1127842/1‑139 (MQ=255) aCGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTc > 2:285845/1‑139 (MQ=255) cGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTcc > 1:794992/1‑139 (MQ=255) gTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCt < 2:806282/139‑1 (MQ=255) tAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGT‑AAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATaa < 2:1272848/138‑1 (MQ=255) gatgaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt > 1:189725/1‑139 (MQ=255) gatgaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt > 1:242691/1‑139 (MQ=255) atgaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt < 2:465497/138‑1 (MQ=255) atgaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt < 1:843949/138‑1 (MQ=255) atgaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt < 1:464344/138‑1 (MQ=255) ccGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGAt > 1:36660/1‑138 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt > 1:927131/1‑130 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt < 2:927131/130‑1 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAAt > 1:522771/1‑139 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAAt > 1:799876/1‑139 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAAt > 1:799847/1‑139 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAAt > 2:655217/1‑139 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAAt > 1:788873/1‑139 (MQ=255) aTGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGc < 2:1023404/139‑1 (MQ=255) aTACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCgg < 1:784321/138‑1 (MQ=255) tACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGt < 2:543453/139‑1 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCt > 1:973998/1‑139 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTggt > 1:1287273/1‑137 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCt > 2:737329/1‑139 (MQ=255) gAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGc < 2:654124/130‑1 (MQ=255) gAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGc > 1:654124/1‑130 (MQ=255) tagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAtt < 2:972602/95‑1 (MQ=255) tagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCAtt > 1:972602/1‑95 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCttttttg > 1:300126/1‑135 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGGttttttg > 2:80482/1‑135 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCttttttg > 2:847761/1‑135 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCTTTTTgg > 2:1110934/1‑138 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGAGCtatttcc > 2:632984/1‑135 (MQ=255) taAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCTTTTTGGaa > 2:10650/1‑139 (MQ=255) gggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGt > 2:544601/1‑75 (MQ=255) gggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGt < 1:544601/75‑1 (MQ=255) ggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCgg < 1:855761/121‑1 (MQ=255) ggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCgg > 2:855761/1‑121 (MQ=255) cATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTTGGAATgaaaa > 1:397541/1‑137 (MQ=255) atTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCTTTTTTGGATgaaagaaa > 1:680558/1‑138 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 2:973998/138‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt > 2:420742/1‑97 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCt < 1:420742/97‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTTGGAATGAAAAAAAATgc > 1:1087280/1‑137 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 2:1127842/138‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 2:1006883/138‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 1:277516/138‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 2:794992/138‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 2:325173/138‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGGTTTTTGGGATGAAAAAAAAAgca > 1:759715/1‑138 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAgca > 1:950426/1‑138 (MQ=255) ccAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaag < 1:221082/139‑1 (MQ=255) ccAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCTTTTTGGGATGAAAGAAAAAgc > 1:691947/1‑136 (MQ=255) cAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGGTTTTTGGTATGAAAGAAaaagaaag > 2:277516/1‑138 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagcaa < 1:1274148/139‑1 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagcaa < 1:205414/139‑1 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagcaa < 1:90721/139‑1 (MQ=255) 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tCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa < 1:950422/138‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa < 1:950444/138‑1 (MQ=255) cTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAg < 2:397541/138‑1 (MQ=255) tataAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCgg > 1:542506/1‑62 (MQ=255) tataAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCgg < 2:542506/62‑1 (MQ=255) tataAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGGTTTTTCGAATTGAAGAAAATGACAGCGATAATATAATAATAGGCTAATTTTTTTGAACACCATTAAACGTatc > 1:957513/1‑139 (MQ=255) tataAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGCGTTTTGGAATGAAAAAAAAAACAAGCAATAATATAAAAAATGCCTAATTTTTTTTAACATCATTAAGCatat > 1:313196/1‑138 (MQ=255) aaaaCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAACAAACAATAAAATAAAAAAGGGCTAATTTTTTTTTACATCATTAAACATatcat > 1:874753/1‑138 (MQ=255) | CAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCAT > NZ_CP009273/4525814‑4526084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |