| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 4,527,329 | A→G | L28P (CTG→CCG) | nanS ← | 9‑O‑acetyl‑N‑acetylneuraminic acid deacetylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 4,527,329 | 0 | A | G | 95.6% | 301.6 / 2.4 | 91 | L28P (CTG→CCG) | nanS | 9‑O‑acetyl‑N‑acetylneuraminic acid deacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base G (34/53); total (36/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
AACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCG > NZ_CP009273/4527196‑4527462 | aaCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGGTGCGTATGCGCCATTCTCGCTAATTGTTTCATTCTGGGTTGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTGCt > 2:13070/1‑139 (MQ=255)aaCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCt > 1:135622/1‑139 (MQ=255)aaCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCt < 2:701553/139‑1 (MQ=255) aCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCtt > 2:475455/1‑139 (MQ=255) aCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCtt < 2:1166202/139‑1 (MQ=255) aCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCtt < 1:929138/139‑1 (MQ=255) aTCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAGGTGACATGGCGGGCCTTCGGGAAGCAAGTGCGCAAATCGAGCTAATTGTTTCATTCTGGGAAGAGGCACCTGTTCCCGATCCGGTAGTGGAAGGCCTTCg > 2:573169/1‑139 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCtt > 1:1123768/1‑135 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCtt < 2:1123768/135‑1 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTTGcc > 1:58324/1‑139 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTTGcc > 2:1199028/1‑139 (MQ=255) gtgtGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCa > 1:784519/1‑139 (MQ=255) tgtgGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTTGCCa > 2:933917/1‑138 (MQ=255) tgGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATa < 2:161556/138‑1 (MQ=255) tgGGAAGTGAGTCAGTGTAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGCCCTCCGGGATGCGTATGCTCAAATCTCGCTAATTGTTTAACTCTTGGATCAGGCGCATCTTCCCGGTCCGGTAATGGTGGTCCTTCGccctt < 2:1205423/138‑4 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:621727/139‑1 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 2:691698/139‑1 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:719434/139‑1 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 2:58324/139‑1 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:1169378/139‑1 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:863492/139‑1 (MQ=255) cAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:1199028/139‑1 (MQ=255) tGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTTGGCCTACACCATgg > 2:1007697/1‑139 (MQ=255) gAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATgg > 1:121808/1‑138 (MQ=255) aGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCttcgccattcgcca > 2:1288692/1‑130 (MQ=255) aGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:1288692/130‑1 (MQ=255) ataatGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGAc < 2:115897/139‑1 (MQ=255) taatGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 2:154591/123‑1 (MQ=255) taatGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa > 1:154591/1‑123 (MQ=255) taatGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCCCCCTACGCCCTGGCATTATACTGAcc > 2:490504/1‑139 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATTCGTATGCGCAAATCTCTCTAATTGTGTAATTCTGGGATGAGGCTCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCACTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 1:573169/138‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 2:946848/118‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa > 1:946848/1‑118 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 2:1027594/138‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 2:501523/138‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 2:682331/138‑1 (MQ=255) gTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACg > 2:85266/1‑139 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCCTACGCCATGGCATTAGACTTACCCGCAACgg > 2:1009533/1‑139 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa < 2:418582/115‑1 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa > 1:138259/1‑135 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 2:138259/135‑1 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACgg > 1:1216878/1‑139 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACgg > 1:659466/1‑139 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGa < 2:696425/125‑1 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGa > 1:696425/1‑125 (MQ=255) ttAAAGAGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCa > 1:418582/1‑115 (MQ=255) aaaGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGt < 2:121808/138‑1 (MQ=255) aaGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTaa < 1:457982/139‑1 (MQ=255) aGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACGGACCAGCAACGGTAAg < 1:13070/139‑1 (MQ=255) tGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGaa < 1:187655/139‑1 (MQ=255) tGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGaa < 2:186727/139‑1 (MQ=255) aCATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAATTCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCAAACGCCATTGGAATAGACTGGCCAGCAACGGTAAGAACa > 1:1117874/1‑139 (MQ=255) aCATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACa < 1:277198/139‑1 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAg < 1:95432/134‑1 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAg > 2:95432/1‑134 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACAt < 2:1219949/139‑1 (MQ=255) gCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGtaataa < 2:135622/139‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 1:348037/139‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 1:995612/139‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 2:93433/139‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 2:554822/139‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 1:407802/139‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCg < 2:855242/137‑1 (MQ=255) cGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGG‑AAGAACATAGTAATAATCggg < 1:304764/138‑1 (MQ=255) 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tCTTCCCTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAg > 2:1281582/1‑139 (MQ=255) cccTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGc < 1:490504/136‑1 (MQ=255) cccTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAg < 1:631919/138‑1 (MQ=255) ccTGTCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAgg < 2:659466/138‑1 (MQ=255) tCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAggg > 2:829784/1‑135 (MQ=255) tCCGGTAATGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAggg < 1:829784/135‑1 (MQ=255) aTGGCGGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCg < 1:1007697/139‑1 (MQ=255) | AACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCG > NZ_CP009273/4527196‑4527462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |