| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 484,563 | G→A | A858T (GCG→ACG) | mscK → | mechanosensitive channel MscK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 484,563 | 0 | G | A | 95.8% | 257.6 / 0.6 | 72 | A858T (GCG→ACG) | mscK | mechanosensitive channel MscK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base A (36/33); total (37/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 | |||||||||||
ATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGT > NZ_CP009273/484431‑484695 | aTCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGAATCACGATCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGa > 1:620088/1‑139 (MQ=255) aCCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGAtt < 1:776793/138‑1 (MQ=255) gtgtTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGc > 2:1263275/1‑138 (MQ=255) gtgtTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCa < 1:565408/139‑1 (MQ=255) ttCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAAc < 1:970214/138‑1 (MQ=255) cTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAAcctgcct > 1:727718/1‑139 (MQ=255) tctcGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGt > 2:1057312/1‑139 (MQ=255) cATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTgg > 2:873450/1‑137 (MQ=255) aTCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAg > 2:978408/1‑139 (MQ=255) aTCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAg > 2:802892/1‑139 (MQ=255) cGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCt > 2:1288056/1‑139 (MQ=255) gCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTg < 1:849248/139‑1 (MQ=255) tGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACt < 2:420245/125‑1 (MQ=255) tGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACt > 1:420245/1‑125 (MQ=255) tGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGc > 1:938209/1‑139 (MQ=255) tACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTcgc > 2:313020/1‑139 (MQ=255) tACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTcgc > 1:503833/1‑139 (MQ=255) tACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTcgc > 1:1221537/1‑139 (MQ=255) aCGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACt < 1:978408/139‑1 (MQ=255) aCGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACt > 1:689051/1‑139 (MQ=255) ggCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTg > 1:1126348/1‑138 (MQ=255) aCTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAata < 1:873450/139‑1 (MQ=255) aGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATgcgc < 2:144171/139‑1 (MQ=255) ggCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAgg > 2:1112955/1‑139 (MQ=255) ggCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAgg > 2:84287/1‑139 (MQ=255) gcTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGgcg < 2:503833/139‑1 (MQ=255) gcTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGgcg < 2:1221537/139‑1 (MQ=255) cGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGcgcg < 2:620088/137‑1 (MQ=255) ggtggtGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGcgtcg < 2:283540/139‑1 (MQ=255) gtgAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTAt < 1:142092/138‑1 (MQ=255) gtgAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTAt < 2:1152463/138‑1 (MQ=255) aaaaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCAt < 1:1074041/139‑1 (MQ=255) aaaaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCAt < 1:1263275/139‑1 (MQ=255) aaaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCa < 1:768153/68‑1 (MQ=255) aaaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCa > 2:768153/1‑68 (MQ=255) aaaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCAt > 2:158465/1‑138 (MQ=255) gTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATtacta < 1:84287/139‑1 (MQ=255) gTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATtacta < 2:671675/139‑1 (MQ=255) tCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATtactac < 1:1057312/139‑1 (MQ=255) tCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATtactac > 1:125592/1‑139 (MQ=255) tCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTa > 2:384261/1‑138 (MQ=255) tCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAc < 2:727718/139‑1 (MQ=255) cTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAca > 2:1184289/1‑139 (MQ=255) ttgttTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAcat < 1:720513/137‑1 (MQ=255) tgttTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAcatcat > 2:185164/1‑139 (MQ=255) tGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCattatt > 2:1276508/1‑139 (MQ=255) tGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCattat < 1:384261/138‑1 (MQ=255) gCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAcat > 2:535550/1‑131 (MQ=255) gCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAcat < 1:535550/131‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGcgcg > 2:146838/1‑95 (MQ=255) ttATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGcgcg < 1:146838/95‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGt > 1:992181/1‑139 (MQ=255) tCGCCTCAATGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTgg > 1:1183803/1‑139 (MQ=255) aTGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGa < 2:689051/139‑1 (MQ=255) aTGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGa < 1:1288056/139‑1 (MQ=255) aTGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGa < 2:667551/139‑1 (MQ=255) aTGGTGGCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGa < 1:1112955/139‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGAc > 1:78700/1‑139 (MQ=255) tggtggCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGAc > 1:35330/1‑139 (MQ=255) gtggCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACg < 2:1183803/138‑1 (MQ=255) tggCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGctct > 2:1149876/1‑54 (MQ=255) tggCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGctct < 1:1149876/54‑1 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATtacta < 1:237663/94‑1 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATtacta > 2:237663/1‑94 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAcat < 2:652224/110‑1 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTAcat > 1:652224/1‑110 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCattat > 2:1046946/1‑116 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCattat < 1:1046946/116‑1 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGa < 2:57041/133‑1 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGa > 1:57041/1‑133 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGgtgt > 2:1262768/1‑139 (MQ=255) gCCTGGACGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGgtgt > 2:1113628/1‑139 (MQ=255) | ATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGT > NZ_CP009273/484431‑484695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |