| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 547,284 | A→G | I256T (ATC→ACC) | purK ← | 5‑(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 547,284 | 0 | A | G | 100.0% | 249.7 / NA | 67 | I256T (ATC→ACC) | purK | 5‑(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (26/41); total (26/41) | |||||||||||
CCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAA > NZ_CP009273/547153‑547413 | ccAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGc < 2:962533/139‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCa < 1:1068058/139‑1 (MQ=255) aGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGtttt < 1:25003/139‑1 (MQ=255) cAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTtg < 1:48738/135‑1 (MQ=255) cAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTtg > 2:48738/1‑135 (MQ=255) tCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 1:820722/139‑1 (MQ=255) tCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 2:599237/139‑1 (MQ=255) tCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 1:286751/139‑1 (MQ=255) aTAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg < 2:1234328/139‑1 (MQ=255) ttCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGttt < 2:914360/120‑1 (MQ=255) ttCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGttt > 1:914360/1‑120 (MQ=255) caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATg > 2:906076/1‑139 (MQ=255) caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATg > 2:156292/1‑139 (MQ=255) tCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGca < 2:494838/139‑1 (MQ=255) tACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg > 2:851477/1‑139 (MQ=255) ccAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcgc < 1:156292/138‑1 (MQ=255) ccAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg < 2:783475/137‑1 (MQ=255) ccAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg < 2:287326/137‑1 (MQ=255) aGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCa < 2:401720/139‑1 (MQ=255) aTTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGt > 1:700417/1‑139 (MQ=255) aTTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGt > 2:936539/1‑139 (MQ=255) atcatcACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCg < 2:700417/138‑1 (MQ=255) tcatcaCCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGtt < 1:1252791/139‑1 (MQ=255) atcaCCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg < 1:1180111/138‑1 (MQ=255) atcaCCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg < 2:900607/138‑1 (MQ=255) aCGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCaa > 2:950847/1‑136 (MQ=255) aCGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCaa > 2:897513/1‑136 (MQ=255) aCGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAg < 1:936539/139‑1 (MQ=255) ttattCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCtt > 1:860372/1‑139 (MQ=255) caccacTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCgg < 2:558401/138‑1 (MQ=255) caccacTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCgg < 1:950847/138‑1 (MQ=255) tGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg < 1:597646/99‑1 (MQ=255) tGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg > 2:597646/1‑99 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 2:243793/81‑1 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc > 1:243793/1‑81 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg < 2:845732/83‑1 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg > 1:845732/1‑83 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg < 2:716352/113‑1 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg > 1:716352/1‑113 (MQ=255) gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACaa < 2:1063694/138‑1 (MQ=255) ttGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACaaaa < 2:1258645/139‑1 (MQ=255) ggTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTg < 2:4606/122‑1 (MQ=255) ggTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTg > 1:4606/1‑122 (MQ=255) ggTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACt < 1:897513/139‑1 (MQ=255) cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGca < 1:1148971/83‑1 (MQ=255) cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGca > 2:1148971/1‑83 (MQ=255) cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATc > 2:954604/1‑139 (MQ=255) cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATc < 1:851477/139‑1 (MQ=255) cAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGc > 1:182186/1‑138 (MQ=255) gATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGccct < 1:455470/139‑3 (MQ=255) gATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCAt < 1:906076/139‑1 (MQ=255) aTCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCAt > 2:440640/1‑138 (MQ=255) ggTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACg < 2:25835/139‑1 (MQ=255) gTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGc < 2:1032329/139‑1 (MQ=255) gTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGc < 2:229753/139‑1 (MQ=255) tAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg > 1:548481/1‑62 (MQ=255) tAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg < 2:548481/62‑1 (MQ=255) tAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGcc > 1:15865/1‑139 (MQ=255) gCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCcaca > 1:742585/1‑138 (MQ=255) cGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGc > 1:631740/1‑139 (MQ=255) gCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGcc < 1:440640/139‑1 (MQ=255) cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc > 1:439345/1‑41 (MQ=255) cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 2:439345/41‑1 (MQ=255) cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGc > 1:247028/1‑63 (MQ=255) cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGc < 2:247028/63‑1 (MQ=255) cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTg > 1:2941/1‑138 (MQ=255) aaCTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATaa < 2:860372/139‑1 (MQ=255) | CCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAA > NZ_CP009273/547153‑547413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |