Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 797,386 | T→C | I15T (ATC→ACC) | ybhI → | anion permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 797,386 | 0 | T | C | 100.0% | 149.3 / NA | 42 | I15T (ATC→ACC) | ybhI | anion permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (21/21); total (21/21) |
AAGTTTATCTTCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGATCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGT > NZ_CP009273/797251‑797514 | aaGTTTATCTTCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGAcccc < 2:1284603/139‑1 (MQ=255) aaGTTTATCTTCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGAcccc < 2:764334/139‑1 (MQ=255) gTTTATCTTCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCAt < 1:94715/139‑1 (MQ=255) aTCTTCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGta < 2:604762/138‑1 (MQ=255) tCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTattatt > 1:616100/1‑139 (MQ=255) tCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTattatt > 1:288623/1‑139 (MQ=255) aTTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGcc < 1:1018961/139‑1 (MQ=255) gTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGc < 1:687568/138‑1 (MQ=255) tCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCgg < 1:1233774/139‑1 (MQ=255) ggACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTaa < 1:1043146/139‑1 (MQ=255) gACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAg > 1:781183/1‑139 (MQ=255) gACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAg > 1:1023336/1‑139 (MQ=255) atcaatAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGaa > 2:449726/1‑139 (MQ=255) atcaatAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGaa < 2:781183/139‑1 (MQ=255) atcaatAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGaa > 1:1212964/1‑139 (MQ=255) tcaatAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAAc > 1:709379/1‑139 (MQ=255) ttCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGc > 1:177901/1‑139 (MQ=255) tATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCttt < 1:747089/137‑1 (MQ=255) gTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGtattat < 1:955738/82‑1 (MQ=255) gTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGtattat > 2:955738/1‑82 (MQ=255) aTACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGttt > 2:291524/1‑85 (MQ=255) aTACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGttt < 1:291524/85‑1 (MQ=255) aTACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTa > 2:1277817/1‑139 (MQ=255) aaagaaCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggc > 1:646983/1‑139 (MQ=255) agaaCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGAcccc > 1:378262/1‑62 (MQ=255) agaaCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGAcccc < 2:378262/62‑1 (MQ=255) gaaCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggcggc < 2:709379/139‑1 (MQ=255) gaaCAGGATTTTAAACGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggcggc < 1:318928/139‑1 (MQ=255) aCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggcggc > 1:847590/1‑137 (MQ=255) aCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggcggc < 2:847590/137‑1 (MQ=255) aCAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCa > 2:451282/1‑139 (MQ=255) aaaTGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAAGTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGc < 2:905467/138‑1 (MQ=255) aaTGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTg < 2:898367/139‑1 (MQ=255) gAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGt > 2:697101/1‑138 (MQ=255) cGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCtttt < 1:464154/94‑1 (MQ=255) cGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCtttt > 2:464154/1‑94 (MQ=255) ttATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTcc > 1:773804/1‑139 (MQ=255) ttATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTcc > 2:400283/1‑139 (MQ=255) tGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCg > 2:1152137/1‑138 (MQ=255) gAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGa < 2:1212964/138‑1 (MQ=255) gAAGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGa < 2:1032005/138‑1 (MQ=255) aaGCTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAAc < 2:1023336/139‑1 (MQ=255) cTAATTCTGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTg < 2:254393/139‑1 (MQ=255) tGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggcg > 2:1253560/1‑92 (MQ=255) tGATATTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTggcg < 1:1253560/92‑1 (MQ=255) atatTAGCGACCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGt > 1:517163/1‑139 (MQ=255) | AAGTTTATCTTCCCTGAAAAAATTCGTTGTCAGGATAAGGACAATCAATAAAGGACTTCTGTATGAGTCATACAGAAAGAACAGGATTTTAAATGAATAAGAAATCGTTATGGAAGCTAATTCTGATATTAGCGATCCCATGTATTATTGGTTTTATGCCAGCTCCGGCAGGATTAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGT > NZ_CP009273/797251‑797514 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |