| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 798,635 | T→C | G431G (GGT→GGC) | ybhI → | anion permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 798,635 | 0 | T | C | 97.5% | 258.6 / ‑3.9 | 80 | G431G (GGT→GGC) | ybhI | anion permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (38/40); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
ATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACA > NZ_CP009273/798502‑798768 | atatCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCAGGCTGGCGAACGTCTCCAGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt < 2:485868/139‑1 (MQ=255) tatCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt < 2:1215318/138‑1 (MQ=255) atCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCa > 2:844900/1‑139 (MQ=255) gCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTg > 1:71046/1‑139 (MQ=255) tGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 2:160401/138‑1 (MQ=255) tGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 1:680484/138‑1 (MQ=255) tGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 1:405203/138‑1 (MQ=255) tGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 2:264139/138‑1 (MQ=255) tGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGt > 1:326517/1‑139 (MQ=255) aTTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAAc > 2:974807/1‑139 (MQ=255) gCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGTGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGTGTGGGTTATAACGATATTaa < 1:207158/138‑1 (MQ=255) gCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGTGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTaa > 2:207158/1‑138 (MQ=255) gCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt > 1:657558/1‑108 (MQ=255) gCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt < 2:657558/108‑1 (MQ=255) gCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGGCATCTTTGGCGTGGGGTATAACGATATTtaa > 2:1248299/1‑139 (MQ=255) cGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCtggtgg < 2:112447/139‑1 (MQ=255) ctcCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttg > 1:874353/1‑139 (MQ=255) cGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 1:977711/138‑1 (MQ=255) cGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 2:409037/138‑1 (MQ=255) cGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 2:465981/138‑1 (MQ=255) cGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 1:680461/138‑1 (MQ=255) cGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGACATTAAATCCTGGtggttggt < 2:22627/138‑1 (MQ=255) gcACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 1:845734/139‑1 (MQ=255) gcACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 2:874353/139‑1 (MQ=255) gcACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 1:1263891/139‑1 (MQ=255) gcACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 1:666084/139‑1 (MQ=255) cACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACg > 2:636439/1‑111 (MQ=255) cACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACg < 1:636439/111‑1 (MQ=255) cACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 2:1263722/138‑1 (MQ=255) cACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg > 1:1263722/1‑138 (MQ=255) ccGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCgg > 1:207805/1‑139 (MQ=255) cGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt > 2:997118/1‑130 (MQ=255) cGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 1:997118/130‑1 (MQ=255) aaTGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACCATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGGCATTAAATCCTGGTGGGTGGTCGGTGCGGTACTg > 2:487168/1‑139 (MQ=255) aTGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGa < 1:578512/139‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg > 1:105513/1‑86 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 2:105513/86‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAAc < 1:1117844/97‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAAc > 2:1117844/1‑97 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt > 1:138509/1‑120 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 2:138509/120‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGata > 1:704093/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGata > 1:288496/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGGGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGata > 2:560055/1‑139 (MQ=255) ccGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGatat > 1:321463/1‑138 (MQ=255) cgcTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAAc > 1:1034600/1‑139 (MQ=255) gcTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGGCGATATTAAcc > 2:614320/1‑139 (MQ=255) tGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCtt > 2:255580/1‑139 (MQ=255) gCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTcc < 2:71046/139‑1 (MQ=255) gCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTc < 2:1034600/138‑1 (MQ=255) ttgttCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTg > 2:1023613/1‑138 (MQ=255) ctcCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCatat > 1:226145/1‑138 (MQ=255) cAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCAcc > 2:287429/1‑139 (MQ=255) aTGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg > 1:101967/1‑54 (MQ=255) aTGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 2:101967/54‑1 (MQ=255) tGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg < 1:844900/139‑1 (MQ=255) tGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg < 2:1049018/139‑1 (MQ=255) gcATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATaa < 1:172885/58‑1 (MQ=255) gcATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATaa > 2:172885/1‑58 (MQ=255) gcATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTgtggtg < 1:749106/139‑1 (MQ=255) aTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGata > 1:687353/1‑61 (MQ=255) aTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGata < 2:687353/61‑1 (MQ=255) aCTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGt > 1:633171/1‑74 (MQ=255) aCTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGt < 2:633171/74‑1 (MQ=255) tATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg > 2:807536/1‑120 (MQ=255) tATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg < 1:807536/120‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGAt > 2:1185334/1‑139 (MQ=255) aTGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGa < 2:500874/81‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGa > 1:500874/1‑81 (MQ=255) tGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGTCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGa < 1:974807/137‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCAccc < 1:499551/110‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATc > 2:699762/1‑139 (MQ=255) tGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATc > 1:101057/1‑139 (MQ=255) tGGCCGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCAccc > 2:499551/1‑110 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTg > 1:645325/1‑138 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTg > 2:731231/1‑138 (MQ=255) cggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCCTATCACCCTCGGCGTGTGGTGGGGGAATATGCTGATCGGCTGGaa > 2:1140490/1‑139 (MQ=255) cggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGAt < 1:229798/130‑1 (MQ=255) cggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGAt > 2:229798/1‑130 (MQ=255) gcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACa < 1:1023613/139‑1 (MQ=255) | ATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACA > NZ_CP009273/798502‑798768 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |