Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 2,982,682 | (A)8→7 | coding (20/483 nt) | BW25113_RS14815 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,982,675 | 0 | A | . | 100.0% | 146.3 / NA | 33 | coding (13/483 nt) | BW25113_RS14815 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (19/14); total (19/14) |
ATCCGTGGTTATACTTCCCTCTTGCAAAATCCTCACCGGGGATGATTGTTATGGCATGCAATAAAAACTATAACCAACATGAAGTGGCAAACTGTTTAACCCTGTCTTACCGTGAGGTTAATCGTGATTGATTATAAAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAGTGGGTTTATTCTCTTCACTGTCTATTCTTACACTGCAGAAAAAATGATATATAACGAAACATGCACTGCAAATTGGGTAATTTTTAAT > NZ_CP009273/2982540‑2982797 | aTCCGTGGTTATACTTCCCTCTTGCAAAATCCTCACCGGGGATGATTGTTATGGCATGCAATAAAAACTATAACCAACATGAAGTGGCAAACTGTTTAACCCTGTCTTACCGTGAGGTTAATCGTGATTGATTATaaaa < 2:655843/139‑1 (MQ=255) cccTCTTGCAAAATCCTCACCGGGGATGATTGTTATGGCATGCAATAAAAACTATAACCAACATGAAGTGGCAAACTGTTTAACCCTGTCTTACCGTGAGGTTAATCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATtatttatt > 2:683171/1‑139 (MQ=255) ctctTGCAAAATCCTCACCGGGGATGATTGTTATGGCATGCAATAAAAACTATAACCAACATGAAGTGGCAAACTGTTTAACCCTGTCTTACCGTGAGGTTAATCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTatttattt > 2:243509/1‑138 (MQ=255) aaaTCCTCACCGGGGATGATTGTTATGGCATGCAATAAAAACTATAACCAACATGAAGTGGCAAACTGTTTAACCCTGTCTTACCGTGAGGTTAATCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTa > 2:437526/1‑139 (MQ=255) 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gTTAATCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAGTGGGTTTATTCTCTTCACTGTCTATTCTTACACTGCAGAAAAAATGATATATAACGAAACATGCACTGCAAATTGGGTAATTTTTa < 2:821736/139‑1 (MQ=255) aaTCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAGTGGGTTTATTCTCTTCACTGTCTATTCTTACACTGCAGAAAAAATGATATATAACGAAACATGCACTGCAAATTGGGTAATTTTTAAt > 2:192993/1‑138 (MQ=255) aTCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAg > 1:46413/1‑49 (MQ=255) aTCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAg < 2:46413/49‑1 (MQ=255) aTCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAGTGGGTTTATTCTCTTc > 1:91611/1‑65 (MQ=255) aTCGTGATTGATTAT‑AAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAGTGGGTTTATTCTCTTc < 2:91611/65‑1 (MQ=255) | ATCCGTGGTTATACTTCCCTCTTGCAAAATCCTCACCGGGGATGATTGTTATGGCATGCAATAAAAACTATAACCAACATGAAGTGGCAAACTGTTTAACCCTGTCTTACCGTGAGGTTAATCGTGATTGATTATAAAAAAAACTTATTATTTATTTTAGTTTTTATCAGTGGGTTTATTCTCTTCACTGTCTATTCTTACACTGCAGAAAAAATGATATATAACGAAACATGCACTGCAAATTGGGTAATTTTTAAT > NZ_CP009273/2982540‑2982797 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |