Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 798,635 | T→C | G431G (GGT→GGC) | ybhI → | anion permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 798,635 | 0 | T | C | 100.0% | 153.8 / NA | 45 | G431G (GGT→GGC) | ybhI | anion permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (23/22); total (23/22) |
CTATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAA > NZ_CP009273/798500‑798766 | cTATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCg < 2:277842/139‑1 (MQ=255) tatCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCCGt < 1:629608/138‑1 (MQ=255) ttGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCtt > 1:512481/1‑139 (MQ=255) tGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGCCATCttt > 2:575381/1‑139 (MQ=255) cTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt < 2:43396/130‑1 (MQ=255) cTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt > 1:43396/1‑130 (MQ=255) aCCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCAGCTTTGGCGTGGGt > 2:182622/1‑139 (MQ=255) tttGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACg < 2:12274/139‑1 (MQ=255) gCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGata > 2:848713/1‑139 (MQ=255) cGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGtggttggt < 2:512481/138‑1 (MQ=255) gcACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 1:848713/139‑1 (MQ=255) gcACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 1:150952/139‑1 (MQ=255) ttAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 1:570138/94‑1 (MQ=255) ttAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg > 2:570138/1‑94 (MQ=255) aTGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTg < 1:72127/138‑1 (MQ=255) aTGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGa < 1:610342/139‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCCTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCCTCTTTGGGGGGGGGTATTACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGGACTGCAGata > 2:72127/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt > 1:5389/1‑75 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt < 2:5389/75‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt > 1:57208/1‑75 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGt < 2:57208/75‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGata > 2:126492/1‑139 (MQ=255) cgcTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAAc > 2:436128/1‑139 (MQ=255) aCTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTg < 2:443684/139‑1 (MQ=255) gttgttCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg < 2:561295/71‑1 (MQ=255) gttgttCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCg > 1:561295/1‑71 (MQ=255) ttgttCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGGGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTg > 1:697099/1‑138 (MQ=255) tGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg < 1:148557/139‑1 (MQ=255) tGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg < 1:558354/139‑1 (MQ=255) aTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCt > 1:135665/1‑125 (MQ=255) aTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCt < 2:135665/125‑1 (MQ=255) aTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg < 2:300632/132‑1 (MQ=255) aTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCgtg > 1:300632/1‑132 (MQ=255) tATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCAccc > 2:212956/1‑112 (MQ=255) tATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCAccc < 1:212956/112‑1 (MQ=255) tATGGCGGCGCGGCAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGa > 1:208742/1‑139 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg > 2:438609/1‑65 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTg < 1:438609/65‑1 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTcc < 1:196372/89‑1 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTcc > 2:196372/1‑89 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTg > 2:140266/1‑138 (MQ=255) cgcggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTg > 1:28528/1‑138 (MQ=255) cggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGa > 1:715261/1‑72 (MQ=255) cggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGa < 2:715261/72‑1 (MQ=255) cggcAGGCCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGGGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGaa > 1:447655/1‑139 (MQ=255) | CTATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAACGTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAA > NZ_CP009273/798500‑798766 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |