Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 100,067 | A→G | G142G (GGA→GGG) | ftsQ → | cell division protein FtsQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 100,067 | 0 | A | G | 100.0% | 177.2 / NA | 48 | G142G (GGA→GGG) | ftsQ | cell division protein FtsQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (22/26); total (22/26) |
CGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATT > NZ_CP009273/99931‑100198 | cGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGgaa < 2:631091/139‑1 (MQ=255) cGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGgaa < 2:56019/139‑1 (MQ=255) cGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTgc > 1:99451/1‑139 (MQ=255) cTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTgccgc < 2:306767/139‑1 (MQ=255) gCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTgccgc > 1:364748/1‑137 (MQ=255) gTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaag > 1:787451/1‑138 (MQ=255) gTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaag > 2:478751/1‑138 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 2:99451/139‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 1:711947/139‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 2:453666/139‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 1:613837/139‑1 (MQ=255) aGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc < 1:752142/139‑1 (MQ=255) gCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATg < 1:728467/139‑1 (MQ=255) gCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTa < 1:679016/138‑1 (MQ=255) gCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTa < 2:384460/138‑1 (MQ=255) tgatgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGc > 1:667740/1‑139 (MQ=255) gATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc < 2:438642/113‑1 (MQ=255) gATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc > 1:438642/1‑113 (MQ=255) tCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcgc > 1:620736/1‑138 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCaa > 1:344680/1‑139 (MQ=255) gTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTa > 2:538664/1‑113 (MQ=255) gTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTa < 1:538664/113‑1 (MQ=255) gTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGaa < 2:344680/138‑1 (MQ=255) gTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAg < 2:787451/139‑1 (MQ=255) atatGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTg < 2:266826/139‑1 (MQ=255) tgacGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg > 2:485645/4‑139 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGaa > 1:646158/1‑128 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGaa < 2:646158/128‑1 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg > 2:18065/1‑139 (MQ=255) aTTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATc > 1:113002/1‑139 (MQ=255) aTTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATc > 2:845471/1‑139 (MQ=255) ttGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATcg < 2:507642/139‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATcgcg > 2:847995/1‑138 (MQ=255) tGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAg < 2:393792/139‑1 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc < 2:94234/69‑1 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc > 1:94234/1‑69 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATg > 1:220727/1‑102 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATg < 2:220727/102‑1 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCt > 2:642648/1‑139 (MQ=255) tatGGTAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCa < 2:667740/139‑1 (MQ=255) tAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGa < 2:620736/139‑1 (MQ=255) tAGACGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGa > 1:61137/1‑139 (MQ=255) aCGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt > 1:509659/1‑52 (MQ=255) aCGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 2:509659/52‑1 (MQ=255) aCGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATcg > 2:632352/1‑109 (MQ=255) aCGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATcg < 1:632352/109‑1 (MQ=255) aCGCGGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGa > 1:45952/1‑136 (MQ=255) gcgGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAt < 1:598222/139‑1 (MQ=255) gcgGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAt < 2:364748/139‑1 (MQ=255) cgGAAGGGAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAtt < 2:113002/139‑1 (MQ=255) agggaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 1:595930/45‑1 (MQ=255) agggaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt > 2:595930/1‑45 (MQ=255) | CGCAAATAGAACAACGCCTGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATT > NZ_CP009273/99931‑100198 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |