| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,483,956 | A→G | S492P (TCA→CCA) | oxc ← | oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,483,956 | 0 | A | G | 100.0% | 72.5 / NA | 21 | S492P (TCA→CCA) | oxc | oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/9); total (12/9) | |||||||||||
GTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATC > NZ_CP009273/2483827‑2484091 | gTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGACACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCAc > 2:300620/1‑138 (MQ=255) tGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAg < 2:437301/138‑1 (MQ=255) cgACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCa < 2:218803/139‑1 (MQ=255) gtggtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCAc > 2:70406/1‑118 (MQ=255) gtggtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCAc < 1:70406/118‑1 (MQ=255) gACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACt > 1:176685/1‑115 (MQ=255) gACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACt < 2:176685/115‑1 (MQ=255) tCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCatta < 1:414706/137‑1 (MQ=255) gtgACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAac > 2:49669/1‑104 (MQ=255) gtgACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAac < 1:49669/104‑1 (MQ=255) gTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCa < 1:418521/124‑1 (MQ=255) gTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCa > 2:418521/1‑124 (MQ=255) cGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg > 1:303674/1‑138 (MQ=255) cGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg < 2:303674/138‑1 (MQ=255) tAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATc > 2:354788/1‑139 (MQ=255) gTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTc > 2:399249/1‑138 (MQ=255) cATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATcc > 2:289238/1‑138 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTctcct > 2:45270/1‑57 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTctcct < 1:45270/57‑1 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTg > 1:338884/1‑138 (MQ=255) ccGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAg > 2:48510/1‑138 (MQ=255) gtggtggtgCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATc < 1:48510/139‑1 (MQ=255) | GTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATC > NZ_CP009273/2483827‑2484091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |