Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 393,907 | A→G | K194E (AAA→GAA) | yaiW → | surface‑exposed outer membrane lipoprotein YaiW |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 393,907 | 0 | A | G | 100.0% | 98.0 / NA | 27 | K194E (AAA→GAA) | yaiW | surface‑exposed outer membrane lipoprotein YaiW |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (15/12); total (15/12) |
CGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACGCTGGCT > NZ_CP009273/393771‑394039 | cgcgATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGgaa < 2:76746/139‑1 (MQ=255) cgATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAAt > 1:474226/1‑139 (MQ=255) aTGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAg > 2:520225/1‑139 (MQ=255) aTGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGgaa < 1:284258/105‑1 (MQ=255) aTGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGgaa > 2:284258/1‑105 (MQ=255) aTGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTc > 1:230111/1‑139 (MQ=255) aTGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTc > 2:377258/1‑139 (MQ=255) cAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCcgcg < 2:91519/139‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCgcggcg > 2:169002/1‑139 (MQ=255) gTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGtt < 1:520225/139‑1 (MQ=255) gTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGtt < 1:377258/139‑1 (MQ=255) aaTCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACtt < 2:230111/139‑1 (MQ=255) gcgcACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTa > 2:246240/1‑139 (MQ=255) aTGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGc > 1:177738/1‑137 (MQ=255) aTGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGc > 1:406418/1‑137 (MQ=255) tGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAg < 2:177738/139‑1 (MQ=255) aGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg < 2:106380/139‑1 (MQ=255) cATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGtt < 1:175111/96‑1 (MQ=255) cATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGtt > 2:175111/1‑96 (MQ=255) aTTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCAc < 1:236316/139‑1 (MQ=255) tGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCAcc > 2:356470/1‑138 (MQ=255) accgCATACCAAAGGGAATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCAGTCAGGCAGTCTTCAGACGCCGCGGCGGGTTGGGGGTTGGGACTTAACATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGGTATACCAtttt > 2:239752/4‑139 (MQ=255) ggTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg > 1:387458/1‑108 (MQ=255) ggTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg < 2:387458/108‑1 (MQ=255) ggTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg > 2:419437/1‑108 (MQ=255) ggTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg < 1:419437/108‑1 (MQ=255) tCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGAttt < 1:556982/129‑1 (MQ=255) tCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGAttt > 2:556982/1‑129 (MQ=255) ccGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACgctggct > 2:130386/1‑139 (MQ=255) ccGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACgctggc < 2:111812/138‑1 (MQ=255) | CGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACGCTGGCT > NZ_CP009273/393771‑394039 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |