| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,035,547 | A→G | I266V (ATC→GTC) | appB → | cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,035,547 | 0 | A | G | 100.0% | 77.7 / NA | 23 | I266V (ATC→GTC) | appB | cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/7); total (16/7) | |||||||||||
TGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAG > NZ_CP009273/1035418‑1035667 | tgGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCgc > 1:240217/1‑139 (MQ=255)tgGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCgc > 2:240830/1‑139 (MQ=255) gCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCt > 1:247032/1‑138 (MQ=255) cTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGa > 2:480877/1‑139 (MQ=255) cTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGa > 2:479332/1‑139 (MQ=255) cTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGa > 2:239971/1‑139 (MQ=255) ccAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTg > 2:215778/1‑139 (MQ=255) gTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCg > 1:300977/1‑139 (MQ=255) ttCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGt > 2:256077/1‑139 (MQ=255) ccAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGt < 1:480877/137‑1 (MQ=255) gTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGt > 2:319353/1‑139 (MQ=255) cAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGc < 1:479332/139‑1 (MQ=255) tACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCAtt > 2:125644/1‑139 (MQ=255) tACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCAtt > 1:323894/1‑139 (MQ=255) tGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGa < 1:361713/58‑1 (MQ=255) tGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGa > 2:361713/1‑58 (MQ=255) tGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTg > 2:345157/1‑98 (MQ=255) tGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTg < 1:345157/98‑1 (MQ=255) tGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTg > 1:60469/1‑121 (MQ=255) tGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTg < 2:60469/121‑1 (MQ=255) ccTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCt > 1:98904/1‑73 (MQ=255) ccTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCt < 2:98904/73‑1 (MQ=255) gAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACggcag < 1:239971/139‑1 (MQ=255) | TGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAG > NZ_CP009273/1035418‑1035667 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |