| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,378,215 | A→G | D329D (GAT→GAC) | yfbK ← | VWA domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,378,215 | 0 | A | G | 100.0% | 90.5 / NA | 26 | D329D (GAT→GAC) | yfbK | VWA domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/14); total (12/14) | |||||||||||
TACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCA > NZ_CP009273/2378094‑2378347 | tACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGt > 2:84584/1‑138 (MQ=255)tACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGt > 1:324097/1‑138 (MQ=255) ccAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTa < 1:106478/138‑1 (MQ=255) aaTTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:202304/139‑1 (MQ=255) aaTTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:324097/139‑1 (MQ=255) aaTTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:287613/139‑1 (MQ=255) gCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATg < 1:296235/138‑1 (MQ=255) cTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGccc < 2:494386/138‑1 (MQ=255) cACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATgcc > 1:460966/1‑126 (MQ=255) cACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATgcc < 2:460966/126‑1 (MQ=255) cGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATgc > 1:44629/1‑123 (MQ=255) cGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATgc < 2:44629/123‑1 (MQ=255) cacCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:554118/77‑1 (MQ=255) cacCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa > 1:554118/1‑77 (MQ=255) acCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGcc < 1:112867/139‑1 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGt > 2:278756/1‑74 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGt < 1:278756/74‑1 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTgg < 2:226964/76‑1 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTgg > 1:226964/1‑76 (MQ=255) tCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTc > 2:159431/1‑137 (MQ=255) ccGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATg < 1:63211/91‑1 (MQ=255) ccGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATg > 2:63211/1‑91 (MQ=255) ccGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGc > 2:4953/1‑139 (MQ=255) cGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATg > 2:222646/1‑90 (MQ=255) cGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATg < 1:222646/90‑1 (MQ=255) ttttGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCa > 2:488130/1‑139 (MQ=255) | TACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCA > NZ_CP009273/2378094‑2378347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |