| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,483,956 | A→G | S492P (TCA→CCA) | oxc ← | oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,483,956 | 0 | A | G | 100.0% | 96.5 / NA | 27 | S492P (TCA→CCA) | oxc | oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/11); total (16/11) | |||||||||||
GTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCAC > NZ_CP009273/2483823‑2484087 | gTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGgtggtggtg > 1:90823/1‑139 (MQ=255) gtggtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAacac > 2:405772/1‑139 (MQ=255) gtggtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAacac > 2:495712/1‑139 (MQ=255) gtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGt < 1:91287/139‑1 (MQ=255) aaGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTTCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGtctc < 1:550799/138‑1 (MQ=255) aGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTctcct < 1:405772/139‑1 (MQ=255) gACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGtct < 2:471277/131‑1 (MQ=255) gACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGtct > 1:471277/1‑131 (MQ=255) cGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGa < 1:495712/139‑1 (MQ=255) tCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCAACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGAGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCat > 1:539653/1‑139 (MQ=255) gTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAAc > 1:166643/1‑138 (MQ=255) aCGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg > 2:283314/1‑139 (MQ=255) cGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGt < 1:257138/83‑1 (MQ=255) cGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGt > 2:257138/1‑83 (MQ=255) gCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATc > 1:52256/1‑139 (MQ=255) aTCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGa > 1:29967/1‑139 (MQ=255) aTACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg < 2:18800/110‑1 (MQ=255) aTACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg > 1:18800/1‑110 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCGGCGCCACTGAGATCAACACCGt < 2:220054/52‑1 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGtc < 1:499275/53‑1 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGtc > 2:499275/1‑53 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGt > 1:220054/1‑52 (MQ=255) tGCAACAGATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTg > 2:227535/1‑138 (MQ=255) gATCCGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCaaa < 1:282028/139‑1 (MQ=255) ccGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAAt > 1:174326/1‑106 (MQ=255) ccGTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAAt < 2:174326/106‑1 (MQ=255) gTTGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCAc > 2:518684/1‑139 (MQ=255) ttGGTGGTGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCAc > 1:348548/1‑138 (MQ=255) | GTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCAC > NZ_CP009273/2483823‑2484087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |