Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 297,613 | (C)5→6 | coding (672/690 nt) | paoA ← | aldehyde dehydrogenase iron‑sulfur subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 297,608 | 1 | . | C | 100.0% | 159.8 / NA | 43 | E226G (GAG→GGG) | paoA | aldehyde dehydrogenase iron‑sulfur subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (20/23); total (20/23) |
TCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCT‑CCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATCGACCGTGACGTGAC > NZ_CP009273/297471‑297740 | tCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTAtct‑c > 1:402668/1‑139 (MQ=255) cAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCT‑ccccccgca < 1:190689/139‑5 (MQ=255) gCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCgcagc < 1:198415/139‑1 (MQ=255) gCTTCAGCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCgcagc < 2:662596/139‑1 (MQ=255) cagATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCa < 2:741989/139‑1 (MQ=255) agATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCaa < 1:7416/139‑1 (MQ=255) agATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCaa < 2:196455/139‑1 (MQ=255) aTTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAg > 1:244918/1‑138 (MQ=255) tGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGAt > 2:185744/1‑139 (MQ=255) tGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGAt > 1:337155/1‑139 (MQ=255) ccgcccgcGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTa < 2:94041/138‑1 (MQ=255) cgcccgcGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGc < 1:214760/139‑1 (MQ=255) cccgcGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTa > 1:520725/1‑135 (MQ=255) cccgcGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTa < 2:520725/135‑1 (MQ=255) ccgcGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTa < 2:402668/139‑1 (MQ=255) gcgcCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGAc < 2:773001/139‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCg < 2:411784/139‑1 (MQ=255) gAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCa > 2:146175/1‑138 (MQ=255) gAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCa > 1:268635/1‑138 (MQ=255) aGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGTGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCa < 1:302017/137‑1 (MQ=255) aGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCa < 2:534200/137‑1 (MQ=255) aGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCAt < 2:6454/138‑1 (MQ=255) aGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATa > 1:517775/1‑139 (MQ=255) aGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATa > 1:154385/1‑139 (MQ=255) gcgcTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATAc < 1:161496/139‑1 (MQ=255) ccgccTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTCGCCGCTCATACGTTCACGGAt < 1:185744/139‑1 (MQ=255) cgccTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGc > 2:657200/1‑93 (MQ=255) cgccTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGc < 1:657200/93‑1 (MQ=255) cgccTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGAtc > 2:49213/1‑139 (MQ=255) ttCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGttt > 2:411587/1‑139 (MQ=255) tCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTg > 2:33119/1‑137 (MQ=255) aaCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCaa < 2:266923/49‑1 (MQ=255) aaCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCaa > 1:266923/1‑49 (MQ=255) aaCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAAt > 2:254369/1‑139 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATg < 2:749045/53‑1 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATg > 1:749045/1‑53 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGtt < 1:55851/55‑1 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGtt > 2:55851/1‑55 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACcaca > 1:382574/1‑70 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATc > 1:358913/1‑139 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATc > 1:194389/1‑139 (MQ=255) aCGCCTTCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGCTAGCGTATGCACcaca < 2:382574/70‑1 (MQ=255) tCATGATTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGAGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATCGACcgt > 1:300265/1‑139 (MQ=255) aTTTTATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATCGACcgtgacg < 2:337155/138‑1 (MQ=255) tATCTCCCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATCGACCgtgacgtgac < 2:358913/138‑1 (MQ=255) | TCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAACGCCTTCATGATTTTATCT‑CCCCCGCAGCATCTTCAATGGCGGCAAGGATGTTAGCGTATGCACCACAGCGACAGATGTTGCCGCTCATACGTTCACGGATCTCATCGGCAGTTGTTTCTGGAGCGGAAACCAAATCGACCGTGACGTGAC > NZ_CP009273/297471‑297740 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |