Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 2,378,215 | A→G | D329D (GAT→GAC) | yfbK ← | VWA domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,378,215 | 0 | A | G | 100.0% | 149.9 / NA | 42 | D329D (GAT→GAC) | yfbK | VWA domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (21/21); total (21/21) |
CTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTT > NZ_CP009273/2378081‑2378342 | cTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGt > 1:748870/1‑139 (MQ=255) tAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCaa > 2:103261/1‑139 (MQ=255) gCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGcc > 1:731886/1‑138 (MQ=255) ccGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCa < 2:330969/138‑1 (MQ=255) aTCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCa > 2:572467/1‑139 (MQ=255) aTCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCa < 2:554751/139‑1 (MQ=255) cGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCAcc > 2:728569/1‑139 (MQ=255) gCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGt > 1:346605/1‑139 (MQ=255) aaTTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 1:103261/139‑1 (MQ=255) ttGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCAc < 2:526004/112‑1 (MQ=255) ttGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCAc > 1:526004/1‑112 (MQ=255) tGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:536096/116‑1 (MQ=255) tGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa > 1:536096/1‑116 (MQ=255) tAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATg < 1:473902/138‑1 (MQ=255) tAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATg < 2:220991/138‑1 (MQ=255) cTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa > 1:756277/1‑108 (MQ=255) cTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:756277/108‑1 (MQ=255) cACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAAc > 2:268077/1‑139 (MQ=255) gCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAAcccc > 2:333432/1‑139 (MQ=255) cAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCtt > 2:476795/1‑139 (MQ=255) aaCGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATgcc < 1:614469/119‑1 (MQ=255) aaCGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATgcc > 2:614469/1‑119 (MQ=255) gagTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa > 1:318975/1‑83 (MQ=255) gagTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:318975/83‑1 (MQ=255) agTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGt < 2:177788/56‑1 (MQ=255) agTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGt > 1:177788/1‑56 (MQ=255) gTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGAt < 1:213524/139‑1 (MQ=255) gTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGAt < 1:651921/139‑1 (MQ=255) cacCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGc < 1:572467/139‑1 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAGTCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGtt > 2:465170/1‑139 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa > 1:474454/1‑72 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCa < 2:474454/72‑1 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCct < 2:469689/124‑1 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCct > 1:469689/1‑124 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGtt > 2:311417/1‑139 (MQ=255) gACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCACCTGCTGATAAGCCAGtt > 2:288000/1‑139 (MQ=255) ttttttGACCATTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCa < 2:699369/139‑1 (MQ=255) ttttttGACCACTGATTCAATCGATTTTGGGTCGTAAATTCCAACGTCAAAGTCACCGTCAGTAGCTAATAAAATGCGATGCATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCACCTGCTGATAAGCCACTTCCAGCCCGGCa < 2:722597/139‑1 (MQ=255) tttGACCATTGATTCAACCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCAcc < 2:399589/138‑1 (MQ=255) gATTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTa < 1:311417/138‑1 (MQ=255) aTTCAATCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACt < 2:718383/139‑1 (MQ=255) aTCGATTTTGGGTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCtt > 1:198955/1‑139 (MQ=255) | CTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTT > NZ_CP009273/2378081‑2378342 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |