Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,246,701 | A→G | I291I (ATT→ATC) | yhaJ ← | DNA‑binding transcriptional regulator YhaJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,246,701 | 0 | A | G | 100.0% | 120.7 / NA | 33 | I291I (ATT→ATC) | yhaJ | DNA‑binding transcriptional regulator YhaJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/17); total (16/17) |
GCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGACACGCAACCGCCCTTCCGCAATATCTTTTTCGACCATAG > NZ_CP009273/3246565‑3246834 | gCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGGAt > 2:645770/1‑139 (MQ=255) ggTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCa < 1:645770/139‑1 (MQ=255) tGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAg > 2:665355/1‑139 (MQ=255) gcagcaATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGa > 2:402607/1‑139 (MQ=255) 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tattTTCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGc > 2:318460/1‑77 (MQ=255) tattTTCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGc < 1:318460/77‑1 (MQ=255) tCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTgacgac > 2:140899/1‑114 (MQ=255) tCCGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTgacgac < 1:140899/114‑1 (MQ=255) cGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGc < 2:333237/43‑1 (MQ=255) cGTTAAAAAGTTTGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGc > 1:333237/1‑43 (MQ=255) tGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGACACGCAAc > 2:280710/1‑107 (MQ=255) tGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGACACGCAAc < 1:280710/107‑1 (MQ=255) tGGGGATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGACACGCAACCGCCCTTCCGCAATATCTTTTTCGACCATAg > 1:390761/1‑138 (MQ=255) | GCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGACACGCAACCGCCCTTCCGCAATATCTTTTTCGACCATAG > NZ_CP009273/3246565‑3246834 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |