Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 4,423,077 | A→C | G255G (GGT→GGG) | qorB ← | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 4,423,077 | 0 | A | C | 100.0% | 117.0 / NA | 32 | G255G (GGT→GGG) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (18/14); total (18/14) |
AGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGC > NZ_CP009273/4422950‑4423204 | agagGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGCCCGCCTTTCGa < 1:257492/139‑1 (MQ=255) aTGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGCCCGCCTTTCGATgcgc > 2:325878/1‑139 (MQ=255) cGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGCCCGCCTTTCGATGCGCCaa > 1:404197/1‑139 (MQ=255) aggaTGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGCCCGCCTTTCGATGCGCCAACGt > 2:115123/1‑138 (MQ=255) 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tcatcaAACAGCCCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGa > 2:309361/1‑120 (MQ=255) tcatcaAACAGCCCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGc > 1:555441/1‑139 (MQ=255) atcaAACAGCCCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCggg < 2:234865/66‑1 (MQ=255) atcaAACAGCCCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCggg > 1:234865/1‑66 (MQ=255) | AGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGC > NZ_CP009273/4422950‑4423204 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |